《黄帝内经》的成书标志着中医学理论体系的建立，其中《黄帝内经》学术体系是其关键。《黄帝内经》主要围绕人的健康、疾病进行阐述，形成了有关人的生命规律及其医学应用的知识和理论，而这些知识和理论的形成，必有古代自然科学、社会科学等方面的知识和方法的渗透与影响，它既是医学理论形成的基础，也是《黄帝内经》学术体系的有机组成部分。因而，《黄帝内经》学术体系结构主要包括医学理论和医学基础两部分。

    医学理论

    《黄帝内经》学术体系医学理论的内容，基本上可以由历代医家对《黄帝内经》内容的分类来概括。在分类研究《黄帝内经》的诸注家中，具有代表性的有：唐代杨上善《太素》分19类，元代滑寿《读素问钞》分11类，明代张介宾《类经》分11类、李中梓《黄帝内经知要》分8类，清代沈又彭《医经读》分4类，虽繁简精粗不同、类别间有出入，但大体可以概括《黄帝内经》医学理论的内容。经过繁简修合、纲目条贯的整理，主要内容如下：

    藏象：是研究脏腑经脉形体官窍的形态结构、生理活动规律及其相互关系的理论。是《黄帝内经》学术体系的核心。“象”，指外在的生命现象，既包括有形可见的躯体肢节脏腑血脉的形象及其动态变化，又包括各种无形的生理、精神现象；“藏”，是指藏于体内有形、无形的脏腑、经络、精气神及其永不休止的活动 ......