考古证今 辨疑订误
李时珍在长期医药研究和临床运用中，发现历代本草书中错误很多，以讹传讹，而有些疑误，诸家又争论不休，一直未得定论。诸如此类，不胜枚举。
李时珍认为“本草一书，关系颇重”，存在的错讹如不予纠正，会误人不浅。再则，宋代《证类本草》刊行以来，已有440多年，其间有不少专业性本草和区域、地方性本草书出现，里面有大量有效且常用的药物需要收进主流本草书中，并且有许多新的重要医学理论，也当采纳、引载。还有李时珍自己多年来收集的经史百家书中有关医药资料，比前代本草书收集的更广泛、更丰富，更当充实进来。
自此，李时珍下定了决心要重新编修一部大型、综合性本草书。
新编本草书，任务颇艰巨，工作量很大，李时珍深思熟虑，蕴酿出全新的可行方案，经过一些筹备，于嘉靖31年(1552)正式开始编纂。至万历21年(1593年)，李时珍以毕生精力，呕心沥血，编纂的大型综合性本草书(中后期由其子孙及门人参予)，终于刻成面世。书名叫《本草纲目》。
众所周知，“纲”是提网之绳，“目”是网之孔眼。引申应用到书籍项目编制，即是大纲与细目的编制。
药分部类 以部为纲，以类为目
《本草纲目》凡例说：“一、神农本草三卷，三百六十五种，分上、中、下三品。梁陶弘景增药一倍，随品附入。唐、宋重修，各有增附，或并或退，品名虽存，旧额淆混，意义俱失。今通例一十六部为纲，六十类为目，各以类从。二、旧本玉、石、水、土混同，诸虫、鳞、介不別，或虫入木部，或木入草部。今各列为部，首以水、火，次之以土、水、火为万物之先，土为万物之母也。次之以金石，从土也。次之以虫、鳞、介、禽、兽，终之以人，从贱至贵也。”
16部顺序及各部所含类数：水(2类)、火(1类)、土(1类)、金石(4类)、草(10类、9类加有名未用1类)、谷(4类)、菜(5类)、果(6类)、木(6类)、服器(2类)、虫(3类)、鳞(4类)、介(2类)、禽(4类)、兽(5类)、人(1类)。
因为李时珍新创以部为纲、以类为目的分类方法，纲举目张，便将空间扩大了，次序理顺了，再多的药物都可以放在它所属部、类中的合适位置上。
立条定种 正名为纲，附品为目
在以往本草书中，药物计数单位因无定则而显混乱。例如《本经》有牛黄，牛角角思 两种，又有《别录》牛乳 ......
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李时珍认为“本草一书，关系颇重”，存在的错讹如不予纠正，会误人不浅。再则，宋代《证类本草》刊行以来，已有440多年，其间有不少专业性本草和区域、地方性本草书出现，里面有大量有效且常用的药物需要收进主流本草书中，并且有许多新的重要医学理论，也当采纳、引载。还有李时珍自己多年来收集的经史百家书中有关医药资料，比前代本草书收集的更广泛、更丰富，更当充实进来。
自此，李时珍下定了决心要重新编修一部大型、综合性本草书。
新编本草书，任务颇艰巨，工作量很大，李时珍深思熟虑，蕴酿出全新的可行方案，经过一些筹备，于嘉靖31年(1552)正式开始编纂。至万历21年(1593年)，李时珍以毕生精力，呕心沥血，编纂的大型综合性本草书(中后期由其子孙及门人参予)，终于刻成面世。书名叫《本草纲目》。
众所周知，“纲”是提网之绳，“目”是网之孔眼。引申应用到书籍项目编制，即是大纲与细目的编制。
药分部类 以部为纲，以类为目
《本草纲目》凡例说：“一、神农本草三卷，三百六十五种，分上、中、下三品。梁陶弘景增药一倍，随品附入。唐、宋重修，各有增附，或并或退，品名虽存，旧额淆混，意义俱失。今通例一十六部为纲，六十类为目，各以类从。二、旧本玉、石、水、土混同，诸虫、鳞、介不別，或虫入木部，或木入草部。今各列为部，首以水、火，次之以土、水、火为万物之先，土为万物之母也。次之以金石，从土也。次之以虫、鳞、介、禽、兽，终之以人，从贱至贵也。”
16部顺序及各部所含类数：水(2类)、火(1类)、土(1类)、金石(4类)、草(10类、9类加有名未用1类)、谷(4类)、菜(5类)、果(6类)、木(6类)、服器(2类)、虫(3类)、鳞(4类)、介(2类)、禽(4类)、兽(5类)、人(1类)。
因为李时珍新创以部为纲、以类为目的分类方法，纲举目张，便将空间扩大了，次序理顺了，再多的药物都可以放在它所属部、类中的合适位置上。
立条定种 正名为纲，附品为目
在以往本草书中，药物计数单位因无定则而显混乱。例如《本经》有牛黄，牛角角思 两种，又有《别录》牛乳 ......
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