广西、海南和云南三地微小按蚊DNA的限制酶切片段长度多态性分析
作者:田春林 石焕焕 何登贤 黄若密 李艳文
单位:广西医科大学寄生虫学教研室 南宁 530021
关键词:微小按蚊;DNA;限制酶切片段长度多态性分析
广西医科大学学报990404
摘要 目的:探讨广西、海南和云南三地微小按蚊之间的基因差异。方法:从三地单雌线蚊虫提取DNA,然后分别用Ava I、Bam HI、Pst I、Bgl I、Hinf I和Hae Ⅲ 6种限制性核酸内切酶消化,进行琼脂电泳分析。结果:三地微小按蚊的Ava I、Bam HI和Pst I酶切区带有差异,Bgl I的酶切区带完全相同,而Hinf I和Hae Ⅲ两种酶不显区带。结论:三地微小按蚊有基因结构差异,Ava I、Bam HI和Pst I 3种限制酶有鉴别意义。
中国图书资料分类法分类号 R38
, 百拇医药
RESTRICTION FRAGMENT LENGTH POLYMORPHISM STUDIES ON THE ANOPHELES MINIMUS DNA FROM GUANGXI,HAINAN AND YUNNAN
Tian Chunlin,Shi Huanhuan,He Dengxian,et al
(Department of Parasitology,Guangxi Medical University,Nanning 530021)
Abstract Objective:To observe the variation in repetitive DNA of the An.Minimus from Guangxi,Hainan and Yunnan.Method:Total DNA was extracted from isofemale lines of the three strains and digested respectively with six restriction endonucleases (Ava I,Bam HI,Pst I,Bgl I,Hinf I and Hae Ⅲ).The DNA fragments were analysed by agarose gel electrophoresis coupled with ethidium bromide staining.The fluorescent DNA bands were visualized under a UV lamp and photographed.Results:Banding patterns produced by Ava I,Bam HI and Pst I show some unique DNA fragments.Bgl I digestion generally gave similar patterns.The latter two enzymes gave vague patterns (results not shown).Conclusion:In view of the variation in repetitive DNA of different area strains of An.minimus,Three enzymes(Ava I,Bam HI and Pst I) were capable of distinguishing among the three area strains.
, 百拇医药
Key words AN.minimus;DNA;RFLD
微小按蚊是东南亚和我国南方山区重要的传疟媒介,许多研究表明:微小按蚊种群内在形态、生态习性、传疟作用和对杀虫剂的敏感性等方面存在差异[1,2]。1988年Sucharit[3] 发现泰国的微小按蚊是一个复合体,含有A和C两个亲缘种,而广泛分布于我国南方山区的微小按蚊是否存在种间差异,这是我国抗疟工作者非常关心的问题。近年来,我国学者用同工酶、细胞遗传学和杂交试验等方法进行了比较研究[4~6],但用分子生物学方法进行研究未见报道。本研究采用限制酶切片段长度多态性分析(RFLD)分析方法,对有地理间隔和海拔高度差异的广西、海南和云南三地微小按蚊,直接从基因结构上探讨它们之间的差异,为明确我国南方微小按蚊的分类和种群分布提供更多的证据。
1 材料和方法
1.1 微小按蚊:广西微小按蚊(A.m.G)采自广西凌云县伶站乡。海南微小按蚊(A.m.H)采自海南儋州市八一农场。云南微小按蚊(A.m.Y)采自云南元江县甘庄乡。在微小按蚊繁殖高峰期(6~10月)从以上三地牛房采集饱血雌蚊,鉴定后带回实验室单只产卵,按常规方法饲养驯化,建立单雌繁殖线。
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1.2 蚊DNA的提取与鉴定:分别收集三地微小按蚊新羽化成蚊,-20℃冻死,按李本文[7]方法,将蚊虫在冰浴下匀浆,然后依次用酚、氯仿和乙醇抽提,获得的基因组DNA经PE缓冲液溶解后,用紫外分光光度计测定DNA浓度,用体积分数为0.4%琼脂糖凝胶电泳鉴定DNA纯度。
1.3 蚊DNA限制酶消化及电泳分析:三地微小按蚊基因组DNA,分别用Ava I、Pst I、Bam HI、Bgl I、Hinf I和Hae Ⅲ 6种限制酶消化,消化条件参照文献[8]。反应体积为20 μl,温度为37℃,消化时间为1 h,每μg DNA的酶用量5~10单位,消化完毕后采用0.85%含0.5 μg/ml溴化乙锭的琼脂糖凝胶电泳分析酶切产物,用紫外分析仪观察结果并照相。
2 结 果
2.1纯化DNA:三地微小按蚊DNA,经琼脂糖电泳观察,均产生小部分降解的DNA碎片,小批量(50只以下)提取的蚊DNA较完整。测定纯化DNA的浓度后可推算50只成蚊可获约30 μg基因组DNA。
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2.2 6种限制酶切结果:见图1、表1。
图1 三地微小按蚊DNA的酶切带型
a 三地微小按蚊DNA的酶切带型:1 A.m.G; 2 A.m.Y; 3 A.m.H;M EcoR I;b 三地微小按蚊DNA的Pst I酶切带型:1 A.m.G; 2 A.m.Y; 3 A.m.H;M EcoR I;c 三地微小按蚊DNA的Bam HI(1,2,3)和Bgl I (4,5,6)酶切带型:M EcoR I;1,4 A.m.G; 2,5 A.m.Y 3,6 A.m.H
表1 三地微小按蚊DNA酶切片段的电泳分析 样品
限制性核酸内切酶
Ava I
Pst I
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Bam HI
Bgl I
Hinf I
Hae Ⅲ
A.m.G
1(0.85)
1(1.25)
2(0.7,0.25)
4(5.7,3.5,0.75,0.5)
-
-
A.m.Y
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3(3.5,0.85,0.5)
-
3(6.6,0.7,0.25)
4(5.7,3.5,0.75,0.5)
-
-
A.m.H
1(3.5)
1(1.25)
-
4(5.7,3.5,0.75,0.5)
-
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-
注:DNA酶切片段长度单位为Kb 在Ava I的酶切带型中,可见A.m.G显一条区带(0.85 Kb),A.m.H显一条区带(3.5 Kb),而A.m.Y显三条区带(3.5,0.85,0.5 Kb)。Pst I酶切带型中,A.m.G和A.m.H均显一条区带(1.25 Kb),而A.m.Y不显区带。Bam HI的酶切带型中,A.m.G显二条区带(0.7,0.25 Kb),A.m.H不显区带,A.m.Y可见三条区带(6.6,0.7,0.25 Kb)。用Bgl I消化,可见三地微小按蚊均显四条区带(5.7,3.5,0.75,0.5 Kb)。用Hinf I和Hae Ⅲ消化,三地微小按蚊未见重复DNA区带。
3 讨 论
随着分子生物学技术的发展,以DNA为基础的媒介昆虫鉴定方法已得到推广应用。对蚊虫的核酸进行限制酶切片段长度多态性(RFLD)分析,就是利用媒介昆虫具有高度的DNA重复序列,在限制性核酸内切酶的作用下,可产生一系列大小不同的DNA酶切片段,用电泳分析消化产物,比较带型差异,将不同虫种区分开来。Sukkid等[9]应用7种限制酶对大劣按蚊4个姐妹种进行RFLD分析,具有明显鉴别意义。李本文等[10]用3种限制酶对赫坎按蚊种内5个亲缘种进行RFLD比较,结果显示重复DNA序列的带型完全能够将其区别。
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微小按蚊广泛分布于我国南方,是否存在种间差异,是我国抗疟工作者非常关心的问题。本实验选用有地理间隔和海拔高度差异的广西、海南和云南三地微小按蚊进行RFLD分析,从结果中可以看出:三地微小按蚊的Bgl I酶切区带完全相同,均显四条区带,并且在其他的限制酶切区带中,相互之间具有共同区带,这表明三地微小按蚊在分类上具有密切的亲缘关系。Hinf I和Hae Ⅲ限制酶消化不显区带,可能是生物学原因,也可能是技术原因。在Ava I和Bam HI酶切区带中,三地微小按蚊之间有明显差异,完全可以将它们互相区分开来。因此,这两种限制酶在三地微小按蚊的鉴别上有很重要的应用价值。此外,三地蚊虫区带的差异也说明了它们之间已有基因分化。在Pst I酶切区带中,可以看到广西和海南微小按蚊均显一条相同的区带,而云南微小按蚊不显区带,提示广西与海南微小按蚊的基因差异小些,而云南微小按蚊具有较明显的基因分化。三地微小按蚊之间的基因差异,是否达到种间差异,需待进一步证实。Curran等[11]认为,重复DNA序列的RFLD与种间自然杂交的能力直接有关。叶奕英[6]曾对广西和云南两地的微小按蚊作杂交试验,结果显示两地微小按蚊有部分生殖隔离现象,这一结果与本实验结果相符,提示了广西和云南两地微小按蚊很可能出现种间分化。
, 百拇医药
参考文献
1 愈 渊,李明馨.海南岛微小按蚊Anopheles (cellia) Minimus Theobald,1901类型的研究.寄生虫学与寄生虫病杂志,1984,2(2):95
2 吴开琛,陈文江,王志光,等.海南省当前微小按蚊的分布特征、生态习性和传疟作用的研究.中国寄生虫学与寄生虫病杂志,1993,11(2):120
3 Sucharit S,Komalamisra N,Leemingsawat S,et al.Population genetic studies of the Anopheles minimus complex in Thailand.Southeast Asian J Trop Pub Hlth,1988,19(4)717
4 蒋成山,刘祖洞,愈 渊,等.微小按蚊非特异性酯酶同工酶的研究.昆虫学报,1987,30(3):229
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5 石裕明,叶奕英.广西微小按蚊卵巢营养细胞多线染色体的观察.中国寄生虫学与寄生虫病杂志,1990,8(2):117
6 叶奕英,许政拱,黄若密,等.广西和云南两地微小按蚊的杂交试验.中国寄生虫学与寄生虫病杂志,1992,10(4):287
7 李本文,潘家复,卢惠霖,等.介绍一种检测蚊虫DNA重复序列的方法.湖南医科大学学报,1989,14(4):402
8 Sambrook J,Fritsch EF,Maniatis T.Molecular cloning:A Lab manual New York.Cold Spring Harbor Laboratory,1986,468
9 Sukkid Y,Sakol P,Ronald R,et al.Diagnostic restriction fragment patterns of DNA from the four isomorphic species of anopheles dirus.Southeast Asian J Trop Med Pub Hlth,1988,9(4):703
10 李本文,卢惠霖,姚开泰,等.赫坎按蚊种团各亲缘种间基因组重复DNA的限制酶切长度差异.中国寄生虫学与寄生虫病杂志 ,1991,8(1):8
11 Curran J,Baillie DL,Webster JM.Use of genomic Dna Restriction fragment length differences to identify nematode species.Parasitology,1985,90:137
收稿日期:1999-01-21, 百拇医药
单位:广西医科大学寄生虫学教研室 南宁 530021
关键词:微小按蚊;DNA;限制酶切片段长度多态性分析
广西医科大学学报990404
摘要 目的:探讨广西、海南和云南三地微小按蚊之间的基因差异。方法:从三地单雌线蚊虫提取DNA,然后分别用Ava I、Bam HI、Pst I、Bgl I、Hinf I和Hae Ⅲ 6种限制性核酸内切酶消化,进行琼脂电泳分析。结果:三地微小按蚊的Ava I、Bam HI和Pst I酶切区带有差异,Bgl I的酶切区带完全相同,而Hinf I和Hae Ⅲ两种酶不显区带。结论:三地微小按蚊有基因结构差异,Ava I、Bam HI和Pst I 3种限制酶有鉴别意义。
中国图书资料分类法分类号 R38
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RESTRICTION FRAGMENT LENGTH POLYMORPHISM STUDIES ON THE ANOPHELES MINIMUS DNA FROM GUANGXI,HAINAN AND YUNNAN
Tian Chunlin,Shi Huanhuan,He Dengxian,et al
(Department of Parasitology,Guangxi Medical University,Nanning 530021)
Abstract Objective:To observe the variation in repetitive DNA of the An.Minimus from Guangxi,Hainan and Yunnan.Method:Total DNA was extracted from isofemale lines of the three strains and digested respectively with six restriction endonucleases (Ava I,Bam HI,Pst I,Bgl I,Hinf I and Hae Ⅲ).The DNA fragments were analysed by agarose gel electrophoresis coupled with ethidium bromide staining.The fluorescent DNA bands were visualized under a UV lamp and photographed.Results:Banding patterns produced by Ava I,Bam HI and Pst I show some unique DNA fragments.Bgl I digestion generally gave similar patterns.The latter two enzymes gave vague patterns (results not shown).Conclusion:In view of the variation in repetitive DNA of different area strains of An.minimus,Three enzymes(Ava I,Bam HI and Pst I) were capable of distinguishing among the three area strains.
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Key words AN.minimus;DNA;RFLD
微小按蚊是东南亚和我国南方山区重要的传疟媒介,许多研究表明:微小按蚊种群内在形态、生态习性、传疟作用和对杀虫剂的敏感性等方面存在差异[1,2]。1988年Sucharit[3] 发现泰国的微小按蚊是一个复合体,含有A和C两个亲缘种,而广泛分布于我国南方山区的微小按蚊是否存在种间差异,这是我国抗疟工作者非常关心的问题。近年来,我国学者用同工酶、细胞遗传学和杂交试验等方法进行了比较研究[4~6],但用分子生物学方法进行研究未见报道。本研究采用限制酶切片段长度多态性分析(RFLD)分析方法,对有地理间隔和海拔高度差异的广西、海南和云南三地微小按蚊,直接从基因结构上探讨它们之间的差异,为明确我国南方微小按蚊的分类和种群分布提供更多的证据。
1 材料和方法
1.1 微小按蚊:广西微小按蚊(A.m.G)采自广西凌云县伶站乡。海南微小按蚊(A.m.H)采自海南儋州市八一农场。云南微小按蚊(A.m.Y)采自云南元江县甘庄乡。在微小按蚊繁殖高峰期(6~10月)从以上三地牛房采集饱血雌蚊,鉴定后带回实验室单只产卵,按常规方法饲养驯化,建立单雌繁殖线。
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1.2 蚊DNA的提取与鉴定:分别收集三地微小按蚊新羽化成蚊,-20℃冻死,按李本文[7]方法,将蚊虫在冰浴下匀浆,然后依次用酚、氯仿和乙醇抽提,获得的基因组DNA经PE缓冲液溶解后,用紫外分光光度计测定DNA浓度,用体积分数为0.4%琼脂糖凝胶电泳鉴定DNA纯度。
1.3 蚊DNA限制酶消化及电泳分析:三地微小按蚊基因组DNA,分别用Ava I、Pst I、Bam HI、Bgl I、Hinf I和Hae Ⅲ 6种限制酶消化,消化条件参照文献[8]。反应体积为20 μl,温度为37℃,消化时间为1 h,每μg DNA的酶用量5~10单位,消化完毕后采用0.85%含0.5 μg/ml溴化乙锭的琼脂糖凝胶电泳分析酶切产物,用紫外分析仪观察结果并照相。
2 结 果
2.1纯化DNA:三地微小按蚊DNA,经琼脂糖电泳观察,均产生小部分降解的DNA碎片,小批量(50只以下)提取的蚊DNA较完整。测定纯化DNA的浓度后可推算50只成蚊可获约30 μg基因组DNA。
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2.2 6种限制酶切结果:见图1、表1。
图1 三地微小按蚊DNA的酶切带型
a 三地微小按蚊DNA的酶切带型:1 A.m.G; 2 A.m.Y; 3 A.m.H;M EcoR I;b 三地微小按蚊DNA的Pst I酶切带型:1 A.m.G; 2 A.m.Y; 3 A.m.H;M EcoR I;c 三地微小按蚊DNA的Bam HI(1,2,3)和Bgl I (4,5,6)酶切带型:M EcoR I;1,4 A.m.G; 2,5 A.m.Y 3,6 A.m.H
表1 三地微小按蚊DNA酶切片段的电泳分析 样品
限制性核酸内切酶
Ava I
Pst I
, 百拇医药
Bam HI
Bgl I
Hinf I
Hae Ⅲ
A.m.G
1(0.85)
1(1.25)
2(0.7,0.25)
4(5.7,3.5,0.75,0.5)
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A.m.Y
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3(3.5,0.85,0.5)
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3(6.6,0.7,0.25)
4(5.7,3.5,0.75,0.5)
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A.m.H
1(3.5)
1(1.25)
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4(5.7,3.5,0.75,0.5)
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注:DNA酶切片段长度单位为Kb 在Ava I的酶切带型中,可见A.m.G显一条区带(0.85 Kb),A.m.H显一条区带(3.5 Kb),而A.m.Y显三条区带(3.5,0.85,0.5 Kb)。Pst I酶切带型中,A.m.G和A.m.H均显一条区带(1.25 Kb),而A.m.Y不显区带。Bam HI的酶切带型中,A.m.G显二条区带(0.7,0.25 Kb),A.m.H不显区带,A.m.Y可见三条区带(6.6,0.7,0.25 Kb)。用Bgl I消化,可见三地微小按蚊均显四条区带(5.7,3.5,0.75,0.5 Kb)。用Hinf I和Hae Ⅲ消化,三地微小按蚊未见重复DNA区带。
3 讨 论
随着分子生物学技术的发展,以DNA为基础的媒介昆虫鉴定方法已得到推广应用。对蚊虫的核酸进行限制酶切片段长度多态性(RFLD)分析,就是利用媒介昆虫具有高度的DNA重复序列,在限制性核酸内切酶的作用下,可产生一系列大小不同的DNA酶切片段,用电泳分析消化产物,比较带型差异,将不同虫种区分开来。Sukkid等[9]应用7种限制酶对大劣按蚊4个姐妹种进行RFLD分析,具有明显鉴别意义。李本文等[10]用3种限制酶对赫坎按蚊种内5个亲缘种进行RFLD比较,结果显示重复DNA序列的带型完全能够将其区别。
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微小按蚊广泛分布于我国南方,是否存在种间差异,是我国抗疟工作者非常关心的问题。本实验选用有地理间隔和海拔高度差异的广西、海南和云南三地微小按蚊进行RFLD分析,从结果中可以看出:三地微小按蚊的Bgl I酶切区带完全相同,均显四条区带,并且在其他的限制酶切区带中,相互之间具有共同区带,这表明三地微小按蚊在分类上具有密切的亲缘关系。Hinf I和Hae Ⅲ限制酶消化不显区带,可能是生物学原因,也可能是技术原因。在Ava I和Bam HI酶切区带中,三地微小按蚊之间有明显差异,完全可以将它们互相区分开来。因此,这两种限制酶在三地微小按蚊的鉴别上有很重要的应用价值。此外,三地蚊虫区带的差异也说明了它们之间已有基因分化。在Pst I酶切区带中,可以看到广西和海南微小按蚊均显一条相同的区带,而云南微小按蚊不显区带,提示广西与海南微小按蚊的基因差异小些,而云南微小按蚊具有较明显的基因分化。三地微小按蚊之间的基因差异,是否达到种间差异,需待进一步证实。Curran等[11]认为,重复DNA序列的RFLD与种间自然杂交的能力直接有关。叶奕英[6]曾对广西和云南两地的微小按蚊作杂交试验,结果显示两地微小按蚊有部分生殖隔离现象,这一结果与本实验结果相符,提示了广西和云南两地微小按蚊很可能出现种间分化。
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参考文献
1 愈 渊,李明馨.海南岛微小按蚊Anopheles (cellia) Minimus Theobald,1901类型的研究.寄生虫学与寄生虫病杂志,1984,2(2):95
2 吴开琛,陈文江,王志光,等.海南省当前微小按蚊的分布特征、生态习性和传疟作用的研究.中国寄生虫学与寄生虫病杂志,1993,11(2):120
3 Sucharit S,Komalamisra N,Leemingsawat S,et al.Population genetic studies of the Anopheles minimus complex in Thailand.Southeast Asian J Trop Pub Hlth,1988,19(4)717
4 蒋成山,刘祖洞,愈 渊,等.微小按蚊非特异性酯酶同工酶的研究.昆虫学报,1987,30(3):229
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5 石裕明,叶奕英.广西微小按蚊卵巢营养细胞多线染色体的观察.中国寄生虫学与寄生虫病杂志,1990,8(2):117
6 叶奕英,许政拱,黄若密,等.广西和云南两地微小按蚊的杂交试验.中国寄生虫学与寄生虫病杂志,1992,10(4):287
7 李本文,潘家复,卢惠霖,等.介绍一种检测蚊虫DNA重复序列的方法.湖南医科大学学报,1989,14(4):402
8 Sambrook J,Fritsch EF,Maniatis T.Molecular cloning:A Lab manual New York.Cold Spring Harbor Laboratory,1986,468
9 Sukkid Y,Sakol P,Ronald R,et al.Diagnostic restriction fragment patterns of DNA from the four isomorphic species of anopheles dirus.Southeast Asian J Trop Med Pub Hlth,1988,9(4):703
10 李本文,卢惠霖,姚开泰,等.赫坎按蚊种团各亲缘种间基因组重复DNA的限制酶切长度差异.中国寄生虫学与寄生虫病杂志 ,1991,8(1):8
11 Curran J,Baillie DL,Webster JM.Use of genomic Dna Restriction fragment length differences to identify nematode species.Parasitology,1985,90:137
收稿日期:1999-01-21, 百拇医药