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我国破译问号钩端螺旋体基因组
http://www.100md.com 2003年5月15日 中国医药报
     一个以我国科学家为主,有法国与美国科学家参与的研究团队,在经过3年多的努力研究后,于4月24日在国际权威科学刊物《自然》杂志上,公布了他们在钩端螺旋体病致病菌———问号钩端螺旋体的全基因组测序及注释方面所取得的成果。我国国家人类基因组南方研究中心执行主任赵国屏教授指出,该研究成果不仅是我国基因组学研究方面所取得的重要成果,更是我国微生物学研究和传染病研究上的一个重大突破。

    问号钩端螺旋体因其形似问号而得名。由问号钩端螺旋体引起的钩端螺旋体病,世界各地均可见,并好发于以水稻种植为主的第三世界国家和地区,是威胁人类健康和畜牧业生产的常见的人畜共患病之一,洪水等自然灾害常可促发该病的暴发流行。由于人们对该病的致病和免疫机制了解粗浅,因此,至今人们对该病缺乏简便的诊断手段和高效、安全的疫苗。虽然抗生素治疗对该病有一定效果,但目前该病依然是一种潜在的、危害严重的自然疫源性疾病。

    几年前,国际上先后对螺旋体中基因组较小(1.2~1.5Mb)、专性寄生的梅毒致病菌和莱姆氏病致病菌进行了全基因组测序和注释。随后,我国与国外若干实验室均开展了对基因组较大(4.7Mb)、兼性寄生的钩端螺旋体的测序工作。

    1999年,国家人类基因组南方研究中心和北方研究中心、国家疾病预防控制中心传染病预防控制研究所等单位的科研人员,开始进行问号钩端螺旋体的基因测序,并于2001年10月,率先向国际公共数据库递交了问号钩端螺旋体的全基因数据。在此基础上,上述科研人员联合中科院上海生命科学研究院、上海第二医科大学、复旦大学、香港大学巴士德研究所、法国巴士德研究所和美国普度大学生化系的科研人员,对问号钩端螺旋体基因组进行了一系列生物信息学注释工作,并在基因组信息的基础上,深入探讨问号钩端螺旋体的分子生理和致病机理。

    该研究发现,问号钩端螺旋体编码rRNA和tRNA的基因数量极少,可能是其生长缓慢的重要原因之一;基因注释全面验证了以往对钩端螺旋体的代谢生理和相关基因的研究结果;发现了一系列具有钩端螺旋体特色的代谢途径;注释了一批可能与侵袭、黏附、运动、趋化、毒性等致病因素相关的基因;发现了若干个潜在的,可能与破坏上皮细胞、干扰凝血平衡系统有关的基因,这为进一步认识钩端螺旋体病的典型小血管上皮细胞损伤和黄疸出血症等严重感染所特有的、广泛的脏器出血,尤其是突发性肺大出血的病理现象,提供了新的思路。, http://www.100md.com(叶国标)