肠球菌分类有14-15种之多，但从人类分离到的主要是粪肠球菌与屎肠球菌两种，前者约占90%，后者占5%-10%。肠球菌对许多抗生素与抗菌药固有耐药，对青霉素类有中度或低度敏感，对糖肽类抗生素如万古霉素、去甲万古霉素、替考拉宁敏感。但自1988年英国首先报道发现万古霉素耐药肠球菌感染以后12年来世界各地都在报道分离到万古霉素耐药肠球菌(VRE)。美国CDC1993年报道美国院内感染病人中万古霉素耐药肠球菌已增至13.6%。万古霉素耐药屎肠球菌(VREF)耐药程度比粪肠球菌高，1999年JAC报道美国VREF从1989年的0.3%增至1993年的9%, 有个别单位增至47% ......
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