3000多年的历史积淀，勿庸置疑的疗效和至今仍然难以解说的科学内涵，让中医始终披着一张神秘的面纱。目前对中医药的现代化研究中，单纯还原分析的研究方法始终有一种一叶障目似的尴尬，如何将以整体、动态、辨证的观点解释生命、把握疾病、用药遣方的中医理论，以全新的科学语言为基础加以验证和发展，是有志于中医药现代化的有识之士 的共同目标。随着生物信息学、系统生物学等研究的兴起，科学家们越来越清楚地认识到，只有以信息系统视角研究同样是系统的、复杂的中医药理论体系，在合理整合和充分利

    用各种数据资源的基础上，进行科学分析、特征提取和规律探索，才能逐步揭示其本质和内涵。

    清华大学生物信息学研究所的生物信息学教育部重点实验室是我国第一个生物信息学重点实验室，也是国内较早开展“生物信息学与中医药现代化”的研究机构。该实验室近期研究的重点方向之一就是中医药生物信息学。负责此项研究的李梢博士是国内率先进行中医药生物信息学研究的专家之一。在他看来，将目前生命科学中最前沿、最热点的研究与中医药联系在一起，以生物信息学的有关理论与方法为桥梁，在中医药学研究中发展相应的信息分析与整合手段，将有助于深入了解以整体观、辨证论治为核心的中医诊疗规律。而其中更深一层的含义是，以信息、系统的观点切入中医药学研究，将有助于推动目前生命科学、医学从“物质实体”向“关系实在”的研究模式的转变；一套行之有效的中医药生物信息分析方法，也将为从多层次信息中发掘中医药的科学内涵，在系统层次上加深对于复杂性疾病的理解提供新的途径。

    复杂系统意义下的中医药学

    随着疾病谱以及生物医学模式的改变，调整生物体自身功能的治疗方案成为科学家们关注的焦点之一。另一方面，以还原论、经验论及纯科学为基础的经典科学正逐步吸收系统论、理性论和人文精神，进而导致一个新兴的研究领域 ---复杂性研究的兴起。目前，从系统观、信息结构、复杂性的角度，探索生命现象与疾病的本质已成为国际生命科学领域的前沿和热点。在这样的科技背景下，李梢认为，以临床实效为生命力的中医药学，是具有重大的理论和应用价值的实际复杂系统。

    中医药研究中的复杂性问题

    中医学的特色是天人合一、整体协调、辨证论治，是天然药物通过君、臣、佐、使等配伍，达到方剂整体的综合效应。李梢认为，中医药学的构成中虽然包含有简单系统的性质，然而，目前中医药现代化研究应重视的是整体、关系、协调等中医学特色的发掘，重视脱离局部、拮抗的诊疗观念以及化学合成药物的框架与弊端，其中凸显出的证候机制研究中的复杂性问题、方剂配伍研究中的复杂性问题、中药药效物质研究中的复杂性问题就成为制约中医药现代化研究的瓶颈 ......