除了淋球菌以外，由其他病原体引起的尿道炎统称为非淋菌性尿道炎(NGU。或称，非特异性泌尿生殖系统感染)。它是当今国内、国外最常见的性传播疾病之一，也可能与淋病并发或交叉感染。好发于青、中年性旺盛期，25岁以下占60%。自60年代中期起，国外人群发病率已经超过淋病。80年代美国每年新发生的病例达300-1000万人。本病直接诊断方法较少而难，临床上也易漏诊，病原体携带者多见，都是造成流行的因素。

    这类尿道炎中，已知其病原体的，则称为真菌性尿道炎和滴虫性尿道炎等，而不再包括在非淋菌性或非特异性尿道炎之内。目前，通常被称为非淋菌性尿道炎的是指衣原体(占40%-50%)、支原体(占20%-30%)及一些尚不明致病病原体的尿道炎。其主要病原体是沙眼衣原体和解脲支原体。前者占40%-60%，后者占20%-40%。根据许多国家报告，NGU中30%-50%，淋病病人中20%和性活动强但无尿道炎症状的人中0.5%，以目前常用的培养方法，尿道分泌物可培养出衣原体。女性病人因多数无症状或仅表现为白带增多等妇科症状，难以确定其发病率，有人估计女性病人可能为男性的4倍。

    衣原体为革兰氏阴性病原体，是一种专性细胞内微生物，没有合成高能化合物ATP、GTP的能力，必须由宿主细胞提供，因而成为能量寄生物，是自然界中传播很广泛的病原体。衣原体与病毒不同，它具有两型核酸：DNA和RNA，并以二等增殖法进行繁殖。与立克次体不同，除了不能合成高能化合物外，还在于没有细胞色素，没有呼吸性电子链的其他组分以及独特的发育周期。衣原体的生长发育周期分两个阶段：原生小体(elementary body)，是发育周期的感染阶段；网状小体(initial body)，是在感染细胞内的繁殖阶段。原生小体先附着于易感细胞的表面，然后通过细胞的吞噬作用进入细胞内，形成网状小体在细胞内繁殖，以后形成包涵体，同时对组织产生炎症变化而引起一系列的临床症状。衣原体的全部生长发育约48小时(有的72小时)，完成生长周期后，网状小体重新组织，在一对一的基础上缩合成原生小体，后者从空泡中释放再感染其他细胞。在整个约48小时的生长发育周期中，衣原体始终处于一个吞噬体中，直到细胞严重损伤和细胞死亡。原生小体在电镜下呈球形，直径200-300毫微米，DNA紧密连接并呈锥状电子密度。分子量6-11*105，明显小于细菌和立克次体，相当于支原体，是大的痘病毒的3-5倍。网状小体呈圆形或椭圆形。

    衣原体属有两个种：沙眼衣原体(Chlamydia trachomatis)和鹦鹉热衣原体。后者引起禽类疾病，偶尔波及到人；前者引起人类疾病 ......