中国艾滋病病毒1型AE循环重组型毒株env基因的变异和进化分析
人类免疫缺陷病毒|基因|变异|进化|分子,中国艾滋病病毒1型aE循环重组型毒株Env基因的变异和进化分析,关键词:
参见附件(89kb)。
梁浩;邢辉;魏民;陈钊;关琪;黄海龙;全宇;陈健平;洪坤学;施侣元;邵一鸣 华中科技大学同济医学院公共卫生学院;中国疾病预防控制中心性病艾滋病预防控制中心 100050北京 中华流行病学杂志 2003 11
关键词:人类免疫缺陷病毒;基因;变异;进化;分子
目的 研究中国艾滋病病毒1型(HIV 1)AE循环重组型(CRF0 1 AE)毒株env不同基因区序列变异的特点及其与进化压力的关系。方法 应用巢式聚合酶链反应(nested PCR)对从全国部分省收集来的HIV 1感染者血液样本中的HIV 1外膜蛋白(env)基因进行扩增和亚型鉴定后,选择3 4份CRF0 1 AE重组型HIV 1毒株env基因V3~V4区及其邻近区域的序列进行系统进化树和氨基酸变异分析,并计算和分析氨基酸同义替换(Ks)值和非同义替换(Ka)值及Ks Ka比值。结果基因系统树显示中国的3 4份样本CRF0 1 AE重组型毒株与我国代表株AE .97CNGX2F和泰国代表株AE .CM 2 40、AE .93TH2 53聚...
关键词:人类免疫缺陷病毒;基因;变异;进化;分子
目的 研究中国艾滋病病毒1型(HIV 1)AE循环重组型(CRF0 1 AE)毒株env不同基因区序列变异的特点及其与进化压力的关系。方法 应用巢式聚合酶链反应(nested PCR)对从全国部分省收集来的HIV 1感染者血液样本中的HIV 1外膜蛋白(env)基因进行扩增和亚型鉴定后,选择3 4份CRF0 1 AE重组型HIV 1毒株env基因V3~V4区及其邻近区域的序列进行系统进化树和氨基酸变异分析,并计算和分析氨基酸同义替换(Ks)值和非同义替换(Ka)值及Ks Ka比值。结果基因系统树显示中国的3 4份样本CRF0 1 AE重组型毒株与我国代表株AE .97CNGX2F和泰国代表株AE .CM 2 40、AE .93TH2 53聚...
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