成军,刘妍,陆荫英,李克,王琳,中国人民解放军第302医院传染病研究所基因治疗研究中心,全军病毒性肝炎防治研究重点实验室 北京市 100039

    国家自然科学基金资助项目,No.C39970674,C03011402

    项目负责人:成军,10039,北京市西四环中路100号,中国人民解放军第302医院传染病研究所基因治疗研究中心,全军病毒性肝炎防治研究重点实验室. cj@genetherapy.com.cn

    电话:010-6693 3391 传真:010-6380 1283

    收稿日期:2002-10-29 接受日期:2002-11-18

    成军,刘妍,陆荫英,李克,王琳. 生物信息学技术与新基因的研究. 世界华人消化杂志 2003;11(4):474-477

    0 引言新基因的克隆化无异是生物医学领域创新知识源泉的重要组成部分. 这一任务,不仅是人类基因组计划(HGP)的核心内容,同时也是后基因组计划(post-HGP)的重要内容. 多年来，随着以人的基因克隆化为主的不同生物类型基因克隆化研究的进展，已然积累了大量的不同生物的基因序列、蛋白质的氨基酸残基序列，同时对于不同生物种属之间基因序列、蛋白质以及结构序列的保守结构位点也积累了丰富的资料，并据此建立了庞大的数据库系统. 对于这些数据的分析，必须依靠计算机分析技术. 计算机分析技术的不断发展，为这些资料和数据的分析建立了一些有效的分析技术. 因此，自然而然就将基因和蛋白质结构的资料与计算机分析技术结合起来，形成了目前极具潜力的新兴交叉学科-生物信息学(bioinformatics)技术^[1]. 生物信息学技术的形成和发展，大大促进了以基因的分子生物学为核心内容的现代生物医学的发展，以基因的分子生物学为核心内容的理论和技术，已经成为生物学领域、医学领域重要的创新知识源泉.

    1 基因序列和氨基酸残基序列同源性比对及其应用基因序列和蛋白质一级结构序列的同源性比对，是目前生物信息学技术中最基本、应用最广泛的技术之一. 随着基因和蛋白一级结构序列数据库的不断扩充，人们甚至单单从数据库的计算机分析就可以克隆新的基因. 目前以美国国家生物工程信息学中心(NCBI，national center of bioengineering information)建立的核苷酸序列数据库(GenBank)及其相应的检索分析系统的应用最为广泛^[2].

    基因序列同源性的比对 ......