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2003年10月19日
在线综合工具
Biology Workbench 3.2 beta
由加州大学圣地亚哥分校国家计算科学与工程实验室提供的基于WEB的生物学工具。经免费注册后，可通过其服务器查询各种最常用的蛋白与核酸数据库，同时提供了各种常用的蛋白与核酸分析工具，并能进行序列排队。完成的工作可以在服务器上存储，供下次使用。主页上有一个使用教程，希望有人能翻译成中文造福大家。
SRS
巴斯德研究所提供的序列检索系统，从此出发，进行序列检索十分方便。
Structure analysis
巴斯德研究所提供的常用结构在线分析工具。
Phylogeny
巴斯德研究所提供的进化分析综合服务，包括了这个领域的常用在线工具。自己去看看有些什么吧。
Sequences Alignments and Comparisons
巴斯德研究所提供的序列排队与比较服务，集合了各种常用的排队与比较服务及在数据库中查找相关序列服务，包括:BLAST、FASTA、WISE、COMBAT、LASSAP等等等等，绝对能满足您的需要。
Sequence formats conversions
巴斯德研究所提供的各种序列格式转换与增减服务器。包括：READSEQ、FMTSEQ、CLUSTALW、sreformat、MVIEW、loadseq、cutseq、pasteseq。
EFETCH
巴斯德研究所提供的各著名数据库数据快速获得服务，给出EMAIL，选择数据库，提供条目名称或编号，快速获取数据。
sewer
200K。为数个HTML格式的页面，可下载后在线使用。是SEquence analysis using WEb Resources的缩写，将网上常用在线工具集合到几个HTML格式的页面，直接从此出发，便能非常方便地使用大多数网上常用的在线工具软件。我翻译成了中文，大家可试试生物软件网SEWER中文在线版。原始网站。
SMS
222K，为Sequence Manipulation Suite的缩写，是DNA与蛋白序列分析与格式化在线工具的集合，常用的在线小工具，均包括在内，需要浏览器支持javascript，可以下载解压后离线使用。我提供了一个SMS中文翻译在线版，结果均以HTML文件格式输出。原始网站。
在线蛋白工具
BCM Search Launcher
蛋白序列二级结构预测综合站点，从此出发，输入蛋白序列，可以根据需要，使用各种在线预测工具，包括Coils、nnPredict、PSSP/SSP、PSSP/NNSSP、SAPS、TMpred、SOUSI、Paircoil、Protein Hydrophilicity/Hydrophobicity Search、SOPM，使用十分方便。
DAS
蛋白跨膜预测服务器、输入蛋白序列，预测跨膜区域。
TopPred 2
斯德哥尔摩大学理论化学蛋白预测服务器提供的膜蛋白拓扑学预测Topology prediction of membrane proteins在线工具
SOSUI
东京农业科技大学(Tokyo University of Agriculture and Technology)提供的膜蛋白分类和二级结构预测在线工具。
PSIpred - MEMSAT2
本蛋白结构预测服务器允许你提交一个蛋白序列，进行二级结构预测与跨膜拓朴结构预测，并将结果用EMAIL提供给您。
HMMTOP
预测蛋白序列的跨膜螺旋与拓扑结构服务器
TMpred
预测蛋白序列跨膜区
TMHMM
预测蛋白的跨膜螺旋
The PredictProtein server
提供蛋白数据库查询，预测蛋白各种结构的服务
SMART
提供蛋白序列，在结构域数据库中查询，显示出其结构域及跨膜区等
SPLIT
膜蛋白二级结构预测服务器
PRED-TMR
提供基于SwissProt数据库统计分析的预测蛋白跨膜片段的服务
CoPreThi
基于INTERNET的JAVA程序，预测蛋白的跨膜区
TMAP
提供预测蛋白跨膜片段的服务
multalin
蛋白序列对照服务器，比较几条蛋白序列的结构。
Protein Sequence Analysis
巴斯德研究所提供的常用蛋白序列分析在线工具，绝对精选。
PSA
Protein Sequence Analysis 服务器为美国波士顿大学生物分子工程研究中心(the BioMolecular Engineering Research Center )开发，提交氨基酸序列，预测二级结构及折叠区域。
PRS
EMBL提供的以未知蛋白序列的氨基酸组成而非氨基酸序列顺序进行蛋白家族及各种特性预测的服务器，并将结果通过EMAIL发给您。
AAA
EMBL氨基酸分析服务器，与上一个服务类似，以氨基酸残基组成为蛋白分析基础数据，结合蛋白数据库进行分析。
在线核酸工具
RNA analysis
巴斯德研究所提供的常用RNA在线分析工具。
Pattern Search and Discovery
巴斯德研究所提供的常用特征序列查询工具。
DNA sequence analysis
巴斯德研究所提供的常用DNA在线分析工具。
Search Genes and Coding Regions
巴斯德研究所提供的基因与编码区查找工具。
Oligonucleotide Calculator
JAVA语言写的寡核苷酸计算器，给出核酸序列，计算GC百分比、解链温度、长度、分子量。可以下载后使用，当小计算器。
解链温度计算器
BCM gene-finder
核酸序列查找服务器，提交核酸序列，选择相应的数据库，进行序列查找。
生物谷严正声明：转载生物谷文章请注明来自生物谷
Biology Workbench 3.2 beta
由加州大学圣地亚哥分校国家计算科学与工程实验室提供的基于WEB的生物学工具。经免费注册后，可通过其服务器查询各种最常用的蛋白与核酸数据库，同时提供了各种常用的蛋白与核酸分析工具，并能进行序列排队。完成的工作可以在服务器上存储，供下次使用。主页上有一个使用教程，希望有人能翻译成中文造福大家。
SRS
巴斯德研究所提供的序列检索系统，从此出发，进行序列检索十分方便。
Structure analysis
巴斯德研究所提供的常用结构在线分析工具。
Phylogeny
巴斯德研究所提供的进化分析综合服务，包括了这个领域的常用在线工具。自己去看看有些什么吧。
Sequences Alignments and Comparisons
巴斯德研究所提供的序列排队与比较服务，集合了各种常用的排队与比较服务及在数据库中查找相关序列服务，包括:BLAST、FASTA、WISE、COMBAT、LASSAP等等等等，绝对能满足您的需要。
Sequence formats conversions
巴斯德研究所提供的各种序列格式转换与增减服务器。包括：READSEQ、FMTSEQ、CLUSTALW、sreformat、MVIEW、loadseq、cutseq、pasteseq。
EFETCH
巴斯德研究所提供的各著名数据库数据快速获得服务，给出EMAIL，选择数据库，提供条目名称或编号，快速获取数据。
sewer
200K。为数个HTML格式的页面，可下载后在线使用。是SEquence analysis using WEb Resources的缩写，将网上常用在线工具集合到几个HTML格式的页面，直接从此出发，便能非常方便地使用大多数网上常用的在线工具软件。我翻译成了中文，大家可试试生物软件网SEWER中文在线版。原始网站。
SMS
222K，为Sequence Manipulation Suite的缩写，是DNA与蛋白序列分析与格式化在线工具的集合，常用的在线小工具，均包括在内，需要浏览器支持javascript，可以下载解压后离线使用。我提供了一个SMS中文翻译在线版，结果均以HTML文件格式输出。原始网站。
在线蛋白工具
BCM Search Launcher
蛋白序列二级结构预测综合站点，从此出发，输入蛋白序列，可以根据需要，使用各种在线预测工具，包括Coils、nnPredict、PSSP/SSP、PSSP/NNSSP、SAPS、TMpred、SOUSI、Paircoil、Protein Hydrophilicity/Hydrophobicity Search、SOPM，使用十分方便。
DAS
蛋白跨膜预测服务器、输入蛋白序列，预测跨膜区域。
TopPred 2
斯德哥尔摩大学理论化学蛋白预测服务器提供的膜蛋白拓扑学预测Topology prediction of membrane proteins在线工具
SOSUI
东京农业科技大学(Tokyo University of Agriculture and Technology)提供的膜蛋白分类和二级结构预测在线工具。
PSIpred - MEMSAT2
本蛋白结构预测服务器允许你提交一个蛋白序列，进行二级结构预测与跨膜拓朴结构预测，并将结果用EMAIL提供给您。
HMMTOP
预测蛋白序列的跨膜螺旋与拓扑结构服务器
TMpred
预测蛋白序列跨膜区
TMHMM
预测蛋白的跨膜螺旋
The PredictProtein server
提供蛋白数据库查询，预测蛋白各种结构的服务
SMART
提供蛋白序列，在结构域数据库中查询，显示出其结构域及跨膜区等
SPLIT
膜蛋白二级结构预测服务器
PRED-TMR
提供基于SwissProt数据库统计分析的预测蛋白跨膜片段的服务
CoPreThi
基于INTERNET的JAVA程序，预测蛋白的跨膜区
TMAP
提供预测蛋白跨膜片段的服务
multalin
蛋白序列对照服务器，比较几条蛋白序列的结构。
Protein Sequence Analysis
巴斯德研究所提供的常用蛋白序列分析在线工具，绝对精选。
PSA
Protein Sequence Analysis 服务器为美国波士顿大学生物分子工程研究中心(the BioMolecular Engineering Research Center )开发，提交氨基酸序列，预测二级结构及折叠区域。
PRS
EMBL提供的以未知蛋白序列的氨基酸组成而非氨基酸序列顺序进行蛋白家族及各种特性预测的服务器，并将结果通过EMAIL发给您。
AAA
EMBL氨基酸分析服务器，与上一个服务类似，以氨基酸残基组成为蛋白分析基础数据，结合蛋白数据库进行分析。
在线核酸工具
RNA analysis
巴斯德研究所提供的常用RNA在线分析工具。
Pattern Search and Discovery
巴斯德研究所提供的常用特征序列查询工具。
DNA sequence analysis
巴斯德研究所提供的常用DNA在线分析工具。
Search Genes and Coding Regions
巴斯德研究所提供的基因与编码区查找工具。
Oligonucleotide Calculator
JAVA语言写的寡核苷酸计算器，给出核酸序列，计算GC百分比、解链温度、长度、分子量。可以下载后使用，当小计算器。
解链温度计算器
BCM gene-finder
核酸序列查找服务器，提交核酸序列，选择相应的数据库，进行序列查找。
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