幽门螺杆菌的基因组及蛋白质组学研究进展
郭刚,邹全明,项目负责人,:,摘要,0,引言,1幽门螺杆菌基因组的基本特点,2Hp基因组的多样性,3Hp的蛋白质组学研究,3.1遗传变异的研究,3.2毒力因子的确定,3.3免疫靶点和诊断靶点的筛选,3.4生理学研究,4有关Hp基因组和蛋白质组信息的网络资源
郭刚,邹全明,中国人民解放军第三军医大学临床微生物学及免疫学教研室 重庆市 400038国家863计划资助课题, No. 2001AA215161
项目负责人:邹全明,400038, 重庆市沙坪坝区,中国人民解放军第三军医大学临床微生物学及免疫学教研室. qmzou@mail.tmmu.com.cn
电话:023-68752316 传真:023-68752316
收稿日期:2003-06-17 接受日期:2003-08-18
摘要随着幽门螺杆菌 26695与J99 菌株基因组测序工作的完成,人们对该菌的基因组学特点有了较清楚的认识,在此基础上,利用生物芯片、2-D电泳、质谱及生物信息学技术开展的后基因组学研究正成为Hp研究的前沿领域.本文首先对幽门螺杆菌的基因组特点及其多样性研究进行了概述,然后重点对后基因组学研究的最新进展进行了综述,特别是对当前Hp蛋白质组研究的核心技术(2-D电泳、免疫印迹、亲和层析及基质辅助激光解析/电离质谱等)的特点及其优缺点以及在Hp遗传变异、免疫靶点筛选及毒力因子确定等方面的应用进行了比较和阐述,对目前Hp的基因组和蛋白质组研究面临的问题及发展趋势也进行了展望.
郭刚,邹全明. 幽门螺杆菌的基因组及蛋白质组学研究进展.世界华人消化杂志 2003;11(12):2022-2026
0 引言自1982年Marshall和Warren[1]从人胃黏膜中分离出幽门螺杆菌(Helicobacterpylori,Hp)之后,大量研究证实他是引起人类慢性活动性胃炎和消化性溃疡的重要原因[2-4],与胃癌和胃淋巴样组织淋巴瘤(MALT)的发生也极度相关[5,6]. 但是,对Hp致病机制、传播途径及其与宿主的关系等方面尚不明确.可喜的是,1997年和1999年相继由Tombet al [7]和Almet al [8]完成了Hp26 695与J99 菌株的基因组测序工作,使对Hp的研究深入到了基因组和蛋白质组水平,这也成为当前Hp研究的前沿与热点.本文就这一方面的研究进展作一综述.
1 幽门螺杆菌基因组的基本特点Hp26 695株的全基因组大约由1667 867对碱基组成,包含在一个环状染色体上.G+C百分含量平均值为39%.在整个基因组中有5个区段的G+C百分含量明显不同.其中两段包含一个或多个插入序列IS605的拷贝 ......
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