中国HIV-1型B、C亚型主要流行株外膜蛋白基因V3-V4区序列的变异分析
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梁浩；魏民；陈钊；邢辉；赵全壁；冯毅；关琪；施侣元；邵一鸣
HIV-1|序列分析|基因型|变异(遗传学)|进化|分子,关键词：
参见附件(306kb)。
梁浩；魏民；陈钊；邢辉；赵全壁；冯毅；关琪；施侣元；邵一鸣 华中科技大学同济医学院公共卫生学院 430030武汉；中国疾病预防控制中心艾滋病预防控制中心 中华实验和临床病毒学杂志 2003 2
关键词：HIV-1；序列分析；基因型；变异(遗传学)；进化；分子
目的 研究我国人类免疫缺陷病毒1型(HIV 1)B、C亚型主要流行株在感染过程中基因变异的特点及其与选择压力的关系。方法 应用巢式聚合酶链反应(nested PCR)对2 5 8例HIV 1感染者血样中的HIV 1外膜蛋白(env)基因进行扩增,并使用ABI 377型测序仪对扩增产物测序后,选择其中37份B亚型和35份C亚型HIV 1毒株env基因包括V3～V4区的序列进行比较分析,并计算和分析氨基酸同义替换与非同义替换的比值(Ks Ka)。结果 B亚型毒株V3～V4区的基因离散率高于C亚型毒株。无论B亚型,还是C亚型毒株,其V4区基因序列较V3区变异更大。在C亚型毒株中,V3区基因序列变异甚至比V3...
关键词：HIV-1；序列分析；基因型；变异(遗传学)；进化；分子
目的 研究我国人类免疫缺陷病毒1型(HIV 1)B、C亚型主要流行株在感染过程中基因变异的特点及其与选择压力的关系。方法 应用巢式聚合酶链反应(nested PCR)对2 5 8例HIV 1感染者血样中的HIV 1外膜蛋白(env)基因进行扩增,并使用ABI 377型测序仪对扩增产物测序后,选择其中37份B亚型和35份C亚型HIV 1毒株env基因包括V3～V4区的序列进行比较分析,并计算和分析氨基酸同义替换与非同义替换的比值(Ks Ka)。结果 B亚型毒株V3～V4区的基因离散率高于C亚型毒株。无论B亚型,还是C亚型毒株,其V4区基因序列较V3区变异更大。在C亚型毒株中,V3区基因序列变异甚至比V3...
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