聚类分析在苯中毒患者肿瘤相关基因表达谱研究中的应用
聚类,,聚类分析；,基因表达；,基因芯片；,苯中毒,基因芯片，亦称,1对象与方法,2结果,3讨论
摘 要： 目的：探讨聚类分析方法在苯中毒基因表达谱研究中的应用价值。方法：从7组正常对照及苯中毒患者外周血提取总RNA，逆转录合成cDNA后，体外转录合成生物素标记的mRNA，与含有2780个cDNA克隆的微阵列肿瘤相关基因芯片杂交，经荧光染料标记后，用芯片扫描仪进行图像扫描，经MIDAS分析软件将扫描的图像信息转化为数据，对样本和基因做聚类分析。结果：重度苯中毒和再障患者的基因表达谱和轻、中度中毒的表达谱明显不同，且具有相似功能的基因具有相似的表达模式。结论：聚类分析方法能根据基因表达谱，将样本进行疾病类型分类，将基因进行功能分类，为苯中毒的早期诊断和预后评估的生物标记物研究提供科学依据。关键词： 聚类分析； 基因表达； 基因芯片； 苯中毒 基因芯片，亦称
cDNA微阵列(cDNAmicroarray)，是将许多特定的基因片段作为探针有规律地排列于固相载体上，样品RNA经荧光标记后与其杂交，计算机系统对杂交信号进行检测分析，从而可同时反应上千个基因的表达状况的一种方法[1，2]。为从成千上万个基因数据中获取更多的基因功能信息，现已有多种数据分析方法，如聚类分析、比值分析、相关性分析等等[3]。本研究采用聚类分析方法对苯中毒患者基因表达谱进行初步分析，以探讨基因表达谱与基因功能和不同中毒类型间的关系。
1 对象与方法
11 样本来源
7名苯中毒工人选自某皮鞋厂被某法定职业病诊断机构确诊研究所确诊为苯中毒患者的女工，其中疑为含苯化学物中毒1例，慢性轻度苯中毒2例，慢性中度苯中毒2例，慢性重度苯中毒1例，再障1例；另选取与实验组性别、年龄、工龄、吸烟饮酒状况等均无显著性差异的健康成人7例 ......
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