胎鼠与成鼠脊髓蛋白质组图谱的构建及其差异分析
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刘玲; 张世强; 杨天祝; 贾宇峰; 赵敏; 张英泽; 潘进
胎鼠;脊髓;蛋白质组;双向电泳;差示蛋白
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刘玲; 张世强; 杨天祝; 贾宇峰; 赵敏; 张英泽; 潘进社
河北医科大学第三医院儿科; 河北医科大学第三医院骨科创伤急救中心; 河北医科大学神经生物研究室; 第四军医大学放射教研室; 河北省胸科医院呼吸科; 河北石家庄; 陕西西安;
【关键词】
胎鼠; 脊髓; 蛋白质组; 双向电泳; 差示蛋白
【发表年期页】
2005,6; 554-558,610
【摘要】
目的初步建立并优化用于脊髓组织蛋白质组分析的双向电泳技术。应用双向电泳技术建立胎鼠与成鼠脊髓蛋白质组图谱,并对两者的差异进行比较,从整体水平上探究成鼠脊髓丧失再生能力的蛋白质基础。方法以大鼠脊髓为研究对象,应用以固相pH梯度等电聚焦为第一向、均一水平十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳为第二向的双向电泳体系,对样品制备、电泳参数、染色等技术环节中影响双向电泳分辨率的关键因素进行一系列的优化。采用ImageMaster 2D Elite图像分析软件对获得的胎鼠与成鼠脊髓蛋白质组2-DE图谱进行图像分析,比较两者在蛋白质组表达上的差异。结果在此优化的实验条件下,获得了质量较好的脊髓组织蛋白质组双向电泳图谱。胎鼠脊髓蛋白质组图谱经图像分析后,可检测到838个蛋白点,成鼠脊髓蛋白质组图谱可检测到847个蛋白点。对胎鼠与成鼠脊髓蛋白质组匹配差示图谱的分析发现,两者间存在813个差示蛋白。结论通过对各种条件的优化,初步建立了脊髓组织2-DE技术。对胎鼠与成鼠脊髓蛋白质组的比较发现,两者存在明显差异。胎鼠与成鼠脊髓蛋白质组差示图谱的建立,为进一步筛选、鉴定与脊髓再生能力丧失有关的蛋白,并探究其作用机制打下了基础。
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