HPV-16(期刊论文)

HPV-16E6 E7 HLA-A2限制性CTL表位的预测

http://www.100md.com 《中华现代妇产科学杂志》 2006年第5期

HPV-16,E6E7；HLA-A2；T淋巴细胞表位；预测；超基序；量化基序,,HPV-16,E6E7；HLA-A2；T淋巴细胞表位；预测；超基序；量化基序,HPV-16E6E7HLA-A2限制

     【摘要】目的预测人乳头瘤病毒(HPV)16型E6 E7癌蛋白的HLA-A2限制性细胞毒性T淋巴细胞(CTL)表位。方法采用超基序法与量化基序方案相结合的办法，对目的蛋白HPV-16E6 E7的HLA-A2限制性CTL表位进行预测。结果 E6、E7各发现3个HLA-A2限制性CTL表位。E6：KLPQLCTEL(18～26)(46.31)、CVYCKQQLL(37～45)(19.96)、FAFRDLCIV(52～60)(8.39)；E7：TLHEYMLDL(7～15)(293.86)、RLCVQSTHV(66～74)(21.08)、LLMGTLGIV(82～90)(7.99)。结论超基序法与量化基序方案联合应用可以提高预测效率。

    【关键词】 HPV-16 E6E7；HLA-A2；T淋巴细胞表位；预测；超基序；量化基序

    Prediction of HLAA2restricted CTL epitope derived from human papilloma virus-16 E6 E7

    ZHANG Li,LV Fenglin.Department of Obstetrics and Gynecology,Kunming General Hospital,Chengdu Military District,Kunming 650032,China

    【Abstract】 Objective To predict the HLAA2restricted CTL epitopes derived from human papilloma virus16E6 E7.Methods HLAA2restricted CTL epitopes of HPV16E6 E7 were predicted by peptied supermotif prediction method combined with quantitativemotif.Results Three HLAA2restricted CTL epitopes of HPV16 E6E7 were found,respectively.There were E6:KLPQLCTEL(18～26)(46.31)，CVYCKQQLL(37～45)(19.96)，FAFRDLCIV(52～60)(8.39)；E7:TLHEYMLDL(7～15)(293.86)，RLCVQSTHV(66～74)(21.08)，LLMGTLGIV(82～90)(7.99).Conclusion The combination of supermotif with quantitativemotif can improve the predictive efficiency. ......

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