王冬纳?何淑明

    【摘要】目的 研究大腸埃希菌感染诱导阴道上皮细胞炎症反应的分子机制。方法 制备大肠埃希菌刺激阴道上皮细胞炎症反应模型，采用RNA测序(RNA-Seq)获取对照组和大肠埃希菌刺激组间的差异表达基因谱，进而使用生物信息学分析差异表达基因的富集信号通路，实时荧光定量PCR(RT-qPCR)验证测序结果。结果 在对照组和大肠埃希菌刺激组间共发现4 899个差异表达基因，其中上调和下调基因分别为1 531和 3 368个。基因本体论(GO)分析显示，其功能富集在生物学行为控制模块的血小板衍生生长因子结合和辅助因子结合、细胞组成模块的内质网伴侣复合物，以及分子功能模块的内质网折叠蛋白方面。京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析显示这些基因富集于39条信号通路，如核因子-κB(NF-κB)通路。RT-qPCR结果与RNA-Seq结果一致，证实大肠埃希菌刺激组细胞TNF-α表达上调(P < 0.05)。结论 TNF-α调控NF-κB信号通路可能是大肠埃希菌诱导阴道上皮细胞炎症反应关键分子机制。

    【关键词】RNA测序；大肠埃希菌；需氧菌性阴道炎；炎症反应

    Molecular mechanism of Escherichia coli-induced inflammatory response in vaginal epithelial cells using RNA-Seq analysisWang Dongna△， He Shuming. △The Second School of Clinical Medicine， Southern Medical University， Guangzhou 510280， China

    Corresponding author， He Shuming， E-mail： 756497548@qq.com ......