洪耀南 许佳烨 潘晓豪 余王琴

    1 浙江中医药大学第一临床医学院 浙江 杭州 310053

    2 浙江中医药大学基础医学院 浙江 杭州 310053

    本研究通过运用网络药理学和分子对接技术探究痛泻要方治疗胃溃疡(GU)的分子机制，报道如下。

    1 材料与方法

    1.1 收集药物潜在活性成分及靶点预测：痛泻要方包含陈皮、白芍、白术、防风4味中药。我们通过中药系统药理学在线平台(TCMSP)，以口服生物利用度(oral bioavailability，OB)≥0.3，类药性指数(drug-like‐ness，DL)≥0.18为临界值筛选出各味中药活性成分与靶点。

    1.2 中药活性成分靶点预测与靶点标准化：根据从TCMSP中筛选出的中药活性成分及靶基因，并通过Swiss Target Prediction数据库、TargetNet数据库进行补充。同时，将3个数据库中查询到的靶基因进行汇总去重。

    1.3 获取胃溃疡的相关基因：通过TTD、OMIM、Gene‐Cards三大数据库，以“gastric ulcer”为关键词进行快速检索得到已知的GU相关疾病靶标。

    1.4 中药活性成分——靶点网络构建：将中药成分靶点和疾病靶点数据上传到在线网站Venny 2.1.0中，以VENN图的形式展现出来，其中交集部分为痛泻要方治疗GU的潜在靶点。并通过Cytoscape 3.7.2软件，以网络图的形式展现相互作用的关系。

    1.5 构建蛋白互作网络筛选核心基因：将靶标集合输入在线STRING 11.0数据库,设置置信度=0.400，获取靶标蛋白的相互作用信息，用获得的相互作用关系数据构建PPI网络。

    1.6 GO富集分析和KEGG通路富集分析：借助R×64 4.0.5软件以及Bioconductor生物信息软件包对痛泻要方治疗胃溃疡的药效靶点进行GO分子功能分析，根据P value进行排序，最后绘制出排序前10位生物过程(biological process，BP)、细胞组分(cellular com‐ponent,CC)、分子功能(molecular function ...... 如果您在使用手机等流览时无法查看或下载全文，可能是被搜索引擎失真“转码”，请点击屏幕最下方的“电脑版”或“原网页”访问。


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