口腔链球菌密度感应信号系统com E基因及luxS基因的检测分析
种间,株系,1材料和方法,1主要仪器和试剂,2细菌分离和培养,3细菌DNA的提取,4引物设计,5PCR反应,6基因检测及测序,7基因序列比较分析,2结果,1PCR产物电泳,2基因序列测定及比较
徐蓉蓉 王斌 葛久禹(1.南京大学口腔医学院 口腔内科学教研室,南京 210008;2.南京大学生命科学院 分子进化实验室,南京 210093)
龈上和龈下牙菌斑的形成是牙龈炎发生的重要因素,往往导致牙周疾病和龋坏[1]。离散的口腔链球菌并不具备致病能力,但当它定植于牙面后往往快速繁殖,并通过密度感应系统(quorum sensing,QS)来激发诱导相关基因的表达,统一协调整个菌群的行为,使整群细菌能够表现出共同的生物学特性,如形成生物膜、表现出耐酸性、产生细菌毒素等,从而具备了离散细菌所不具备的致病能力[1]。由此可见,密度感应系统在口腔细菌的致病过程中发挥着重要的作用。在口腔链球菌中,种内的密度感应系统由CSP(competence stimulating peptide)信号肽与调控系统组成,至少包括6个基因(comA、B、C、D、E、X)[2]。其中comE基因编码胞内反应调控蛋白,负责结合并调节下游目标基因的表达,以帮助链球菌适应牙菌斑内高密度的生存环境[3]。不同链球菌种间的密度感应信号由另外一类信号分子——自诱导体2(autoinducer-2,AI-2)来传导。此信号分子的合成途径已经基本确定,其中标志性的酶称为luxS蛋白酶,是luxS基因的编码产物。luxS蛋白酶参与合成的AI-2同样可调控不同口腔细菌的生理功能和毒力,以适应周围环境的变化[4-5]。
本实验将检测口腔链球菌临床分离株系NH521中是否存在相关密度感应基因comE及luxS,并将其基因序列与GenBank数据库中的相关序列进行比较,为研究密度感应系统的相关基因在不同口腔链球菌种内及种间的分化模式和作用机制奠定基础。
1 材料和方法
1.1 主要仪器和试剂
基因扩增仪(Biometra公司,德国),凝胶电泳仪(上海天能科技有限公司),凝胶成像分析系统(UVP公司,美国),离心机(Sigma公司,德国);细菌基因组提取试剂盒(杭州爱思进生物技术有限公司),引物合成、基因测序(南京金斯瑞生物科技有限公司) ......
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