小泛素化修饰基因-1多态性与非综合征型唇腭裂的相关性研究
唇裂,等位基因,1材料和方法,1研究对象,2聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(polymerasechainreaction-restrictionfragmentlengthpolymorphism
郭胜胜 章根训 王杨洋 马坚 任红旺 赵桂治 李亚娣 石冰 黄永清,(1.宁夏医科大学口腔医学院 研究生部;2.宁夏医科大学附属医院 口腔颌面外科,银川 750004;3.四川大学华西口腔医院 唇腭裂外科,成都 610041)
非综合征型唇腭裂(non-syndromic oral clefting,NSOC)是最常见的先天性颅面畸形之一,世界范围内发病率约为1‰~2‰。不同人群NSOC的发病率存在差异[1],我国新生儿的发病率约为1.82‰[2]。NSOC病因较为复杂,目前普遍认为该疾病是由遗传因素、环境因素及二者的交互作用所致[3-4]。NSOC具有遗传异质性,对不同人群研究所得结果不尽相同。
本课题组研究[5-7]并证实了干扰素调节因子6(interferon regulatory factor 6,IRF6)基因和同源异形盒基因MSX1与NSOC具有相关性。小泛素化修饰基因-1(small ubiquitin-related modifier-1,SUMO-1)编码的小泛素化修饰蛋白是一种修饰蛋白,对T-box transcription factor 22(TBX22)[8]及MSX1[9]基因具有调控作用。因此,有必要研究SUMO-1基因与NSOC是否具有相关性。为此本研究选择SUMO-1基因rs6709162、rs7599810和rs7580433位点,研究和探讨宁夏人群SUMO-1基因位点单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)与NSOC的相关性。
1 材料和方法
1.1 研究对象
本研究收集2006年1月—2009年12月就诊于宁夏医科大学附属医院口腔颌面外科的NSOC患者核心家系(家族3代以上为宁夏人)为研究对象,共收集唇裂患者55例、腭裂58例、唇腭裂95例,患者父亲189例、患者母亲176例,完整核心家系(患者及其父母)172个。所有病例均排除了其他先天性畸形及综合征型唇腭裂。经宁夏医科大学附属医院伦理委员会讨论通过,签订书面知情同意书后,采集研究对象的外周全血5 mL。此外,收集同期、相同地区出生的正常对照组新生儿284例,抽取脐带血5 mL。
1.2 聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphisms,PCR-RFLP)检测
将收集到的5 mL全血 ......
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