人牙源性多能干细胞重编程前后微小RNAs差异表达谱系分析
缓冲液,克隆,1材料和方法,2结果,3讨论
谭小兵戴青原1.云南省第一人民医院口腔内科;2.昆明医科大学第一附属医院心内科,昆明 650032
人牙源性多能干细胞重编程前后微小RNAs差异表达谱系分析
谭小兵1戴青原2
1.云南省第一人民医院口腔内科;2.昆明医科大学第一附属医院心内科,昆明 650032
目的 对比研究两种人牙源性多能干细胞重编程前后微小RNAs(m iRNAs)差异表达,交集分析、筛选特异性m iRNAs。方法 利用仙台病毒将人牙髓干细胞(DPSCs)和根尖乳头干细胞(SCAP)重编程为诱导性多潜能干细胞(iPSCs),提取总RNA,m iRNAs标记、杂交,扫描芯片、读取图像,筛选差异表达m iRNAs,交集分析。
结果 人DPSCs和SCAP均可重编程为iPSCs。m iRNAs芯片分析结果显示人DPSCs重编程后有68个差异表达m iRNAs(倍数>10),其中37个表达上调,31个表达下调;人SCAP重编程后有107个差异表达m iRNAs(倍数>10),其中
68个表达上调,39个表达下调。二者取交集,均上调的有miR-302e,下调的有m iR-29b-3p、m iR-181b-5p、m iR-4328、
m iR-22-5p、m iR-145-5p、m iR-4324、let-7b-5p、m iR-181a-5p、m iR-27b-3p(倍数>10)。结论 人DPSCs和SCAP重编程为iPSCs过程中有多种m iRNAs参与,多数与细胞周期、上皮-间充质转化、转化生长因子β信号通路等相关。
诱导性多潜能干细胞; 牙髓干细胞; 根尖乳头干细胞; 重编程; 微小RNAs
近十年来干细胞研究领域的突破性进展之一就是诱导性多潜能干细胞(induced pluripotent stem cells,iPSCs)的建立[1-2]。体细胞可通过多种方法重编程为iPSCs,主要分为病毒性载体和非病毒性载体,如RNA、微小RNAs(m icroRNAs,m iRNAs)转染等[3]。学者[4]对iPSCs的复杂调节网络、m RNA和m iRNAs进行了全基因组研究,其中引起更多关注的就是m iRNAs。m iRNAs通过降解靶mRNA或阻止蛋白合成以调节多种目标基因的表达。m iRNAs在各种细胞中均有表达,包括胚胎干细胞(embryonic stem cells,ESCs)、iPSCs和体细胞。通过对不同人ESCs、iPSCs的m iRNAs及mRNA表达的研究,发现了许多共同表达的m iRNAs簇 ......
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