赵格 黎昌学 郭超 朱慧

    石河子大学医学院第一附属医院口腔科，石河子 832000

    口腔癌是全球第九大恶性肿瘤，其中90%以上是口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma，OSCC)，5年生存率仅为50%[1]。TNM分期是口腔癌的关键预后因素[2]。然而，由于高度异质性，TNM分期不能描述同一分期患者的个体风险。因此，需要新的生物标志物来区分高危患者，以帮助指导治疗。

    微小RNA(microRNA，miRNA)是长度为18～25个核苷酸的非编码RNA，通过与其靶向mRNA的3’-非翻译区结合来调节基因表达，导致了mRNA降解或抑制mRNA翻译[3]。越来越多的研究[4-5]显示，miRNA在肿瘤细胞的生长、分化、增殖和凋亡等过程中发挥了重要的作用。部分miRNA已作为生物标志物开始应用到OSCC的诊断及预后判断[6-7]。

    近年来，人们对癌症预后生物标志物进行了大量研究。与单一的生物标记物相比，多个基因的组合在预测个体预后方面显示了它们的优势[8-9]。本研究基于癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas，TCGA)数据库，通过单因素和多因素Cox风险回归分析筛选和建立miRNA预后模型，以期对OSCC患者进行精准分组并为治疗提供依据。

    1 材料和方法

    1.1 数据下载

    截止于2020年2月9日从TCGA数据库下载OSCC相关miRNA表达信息(398个肿瘤样本和32个正常样本)、mRNA表达信息(381个肿瘤样本和32个正常样本)和相关临床资料(401例)。从miRBase网站下载所有成熟miRNA序列，用Perl语言将其与差异表达miRNA合并。

    1.2 差异表达分析

    将下载的原始数据标准化处理后进行log2转换，使用R语言edgeR包比较肿瘤组与正常组miRNA和mRNA的表达差异，最终选取衡量错误发现率的指标(false discovery rate，FDR)<0.05，|log2FC|>1(FC为差异倍数，fold change)的差异基因与生存时间≥30 d的患者临床信息(共388例年龄为19～88岁患者 ......