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编号:642850
宏基因组测序技术在颌面部间隙感染细菌分布中的研究
http://www.100md.com 2021年8月14日 华西口腔医学杂志 2021年第4期
厌氧菌,革兰,链球菌,1材料和方法,1一般资料,2样本采集,3检测方法,4mNGS微生物阳性判定方法,5观察指标,6统计分析,2结果,1部分因素与革兰阳性菌和阴性菌比例的关系,2检验周期,阳性检出率的比较,3厌
     陈怡恒 郑宏雨 李紫璇 吴永超 牛志兴 彭彦惠 赵军方 孙强

    郑州大学第一附属医院口腔颌面外科,郑州450052

    口腔颌面部感染是口腔颌面外科最常见急症之一,多继发于牙源性及腺源性感染,由于口腔颌面部解剖结构存在上行及下行的潜在通道,感染易向颅内、纵隔扩散,导致脑脓肿、纵隔脓肿、脓毒症等严重并发症的发生,病情凶险威胁患者生命[1],以往资料[2]表明,其死亡率高达61.5%。颌面间隙感染致病菌的早期确定及针对性用药尤为重要,然而传统病原微生物检测手段虽具有快速、简单、成本及技术要求低等特点,但无法对标本所含病原微生物做出整体分析。尤其是病毒、未知或难培养的病原微生物,目前的检测方法为涂片、培养、聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)等,均具有较大局限性[3-4]。近年来,宏基因组测序(metagenomic next-generation sequencing,mNGS)技术越来越受到重视,可以在不使用任何引物或探针的情况下,对待测样品所有DNA片段进行扩增和测序[5]。理论上,mNGS可以在一次实验中识别所有潜在的病原体,对标本中可能存在的病原体进行全面检测,从而有助于颌面部间隙感染的早期诊断。

    1 材料和方法

    1.1 一般资料

    收集2020年3—6月郑州大学第一附属医院口腔颌面外科收治的符合入选排除标准的16例颌面部间隙感染患者的临床资料,其中男性12例,平均年龄为(54.08±17.21)岁;女性4例,平均年龄为(71.15±12.50)岁。感染部位分别为单间隙9例,多间隙7例。感染来源分别为牙源性12例,非牙源性4例。纳入标准:1)年龄>18岁;2)确诊为颌面部间隙感染患者;3)应用抗生素前已留取病变局部抽吸脓液;4)患者或其家属已签署知情同意书。排除标准:1)妊娠期妇女;2)合并颌面部外其他部位感染;3)送检样本的微生物核酸含量<100 copies·mL-1。

    1.2 样本采集

    应用抗生素前收集患者颌面部局部肿胀抽吸液2份,同时送医院微生物培养以及临床精准用药中心进行病原体mNGS。样本量:医院微生物培养需要抽吸液样本至少1 mL,及时送检;mNGS样本需抽吸液至少2 mL,4~20℃暂存,2 h内送检,如不能及时送检,-20℃保存,24 h内送检。

    1.3 检测方法

    1.3.1 常规细菌培养 采用梅里埃VITEK 2 Compact全自动细菌鉴定及药敏分析系统对脓液进行细菌鉴定及药敏试验分析 ......

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