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编号:37876
基于反向分子对接技术的异鼠李素靶标的预测Δ
http://www.100md.com 2016年11月18日 2016年第28期
还原酶,凝血酶,1材料与方法,2结果,3讨论,4结语
     崔明超,陈少军,崔 文,董 珂,江海龙,周海滨,凌庆枝#(.浙江医药高等专科学校中药学院,浙江宁波 500;2.南京中医药大学药学院,南京 2006;.青岛大学附属医院崂山院区,山东青岛 26600;.宁波立华制药有限公司,浙江宁波 57)

    基于反向分子对接技术的异鼠李素靶标的预测Δ

    崔明超1,2*,陈少军1,崔文3,董珂1,江海龙4,周海滨4,凌庆枝1#(1.浙江医药高等专科学校中药学院,浙江宁波315100;2.南京中医药大学药学院,南京210046;3.青岛大学附属医院崂山院区,山东青岛266003;4.宁波立华制药有限公司,浙江宁波315174)

    目的:利用反向分子对接技术对异鼠李素的潜在靶标进行预测。方法:采用idTarget软件对蛋白质数据库中异鼠李素的潜在靶标进行筛选,利用PyRx 0.8软件中的autodock vina模块对筛选的结果进行分子对接验证。结果:异鼠李素与硫氧还蛋白还原酶1、凝血酶、二氢叶酸还原酶、核受体ROR-α等4种靶蛋白的结合较好,其结合能(ΔGpred)分别为-11.7、-10.34、-10.11、-10.07 kcal/mol;分子对接验证结果显示,异鼠李素与4种靶蛋白核心氨基酸具有静电作用力、氢键、范德华力等相互作用。结论:硫氧还蛋白还原酶1、凝血酶、二氢叶酸还原酶、核受体ROR-α可能是异鼠李素的潜在靶标。

    异鼠李素;反向分子对接;靶蛋白;硫氧还蛋白还原酶1;凝血酶;二氢叶酸还原酶;核受体ROR-α;相互作用

    异鼠李素(Isorhamnetin,C12H16O7)是一种黄酮类成分,广泛存在于白果、车桑仔叶、柽柳、醋柳果、红车轴草、槐角、黄花蒿、喙果绞股蓝、宽叶香蒲、蒲黄、水芹、狭叶香蒲、茵陈蒿等多种药用植物之中,研究证实其具有抗肝毒、抗氧化、抑制脂类过氧化、抑制血小板聚集等多种作用[1]。浙贝母(Fritillaria thunbergii Miq.)传统习用其鳞茎,而浙贝母花为浙贝母植物的干燥带茎梢的花,在临床上已用于治疗咳嗽痰多、支气管炎等症[2]。目前研究发现浙贝母花含有生物碱、黄酮、挥发油等成分,而异鼠李素是其中一个重要的资源性成分[3]。

    反向分子对接技术是新药研究开发中的一种重要手段。其工作原理是以小分子化合物为探针,在已知结构的靶标数据库中检索可能与之相结合的生物大分子,并通过能量匹配和空间的调整形成分子复合物,进而预测药物发挥作用的靶标[4]。因此,一方面,反向分子对接技术可以用于研究某些已经上市销售多年的药物,通过对其分子靶标进一步深入认识 ......

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