刘福和，陈少军，倪文娟(浙江医药高等专科学校药学院，浙江宁波 315100)

    川芎中抗血栓活性成分的计算机虚拟筛选研究Δ

    刘福和*，陈少军，倪文娟(浙江医药高等专科学校药学院，浙江宁波 315100)

    目的：运用计算机辅助药物设计寻找川芎抗血栓活性成分。方法：以“血栓症”为关键词，从治疗靶蛋白数据库中搜索筛选川芎抗血栓靶蛋白；再从蛋白质数据库中查询目标靶蛋白并下载其三维结构，采用蛋白质预处理工具确定活性区域中心坐标，应用PyRx和Discovery Studio Visualizer软件对从台湾中医药资料库下载的247个川芎小分子与靶蛋白进行分子对接，通过结合能筛选出活性成分并分析结合作用力。结果：筛选出4个活性成分即新绿原酸、1-H-苯并咪唑-2-胺、3，8-二羟基酰内酯、川芎三萜，其分别与凝血酶、抗凝血酶Ⅲ、凝血因子Ⅹa、血栓调节蛋白具有较高结合活性，结合能分别为-6.1、-4.5、-7.7、-8.6 kJ/mol；分析结果显示范德华力、静电作用力在对接中发挥着重要作用。结论：新绿原酸、1-H-苯并咪唑-2-胺、3，8-二羟基酰内酯、川芎三萜可能是中药川芎抗血栓的活性成分。

    血栓症；川芎；计算机辅助药物设计；虚拟筛选；靶蛋白；分子对接；活性成分

    血栓形成及血栓栓塞性疾病是临床常见急重症类疾病，祖国传统医学将其归为“血瘀”范畴，治疗以益气活血、祛瘀通络为主；而川芎作为常用活血化瘀中药之一，已被证实具有良好的抗血栓作用；但其提取物中含有挥发油、生物碱、酚、有机酸及苯酞内酯等多种化学物质[1-3]，常规检测手段难以有效确定活性成分。计算机辅助药物设计(Computeraided drug design，CADD)是一种伴随计算机技术、蛋白质组学以及人类基因组计划发展而形成的新药开发技术，其以计算机化学研究技术为基础，通过对药物与受体生物大分子的关系进行模拟、计算及预算，从而设计并优化合成先导化合物[4]。已有研究显示，CADD技术可快速有效地确定中药有效成分和作用机制，科学客观地对中药独特药理作用进行阐述，已成为中药新药设计关键技术之一[5]。在CADD模式下进行中药活性成分筛选，需首先对化合物分子进行虚拟筛选，在降低筛选化合物数量的同时提高先导化合物发现效率[6]。川芎中川芎嗪、阿魏酸的抗血栓作用已被广泛证实[7]，本次研究采用PyRx软件的Autodock vina模块对中药川芎有抗血栓活性的其他成分进行筛选和评价，拟探讨运用CADD寻找中药川芎新的抗血栓活性成分的可行性及其意义，为中药川芎的现代化研究提供理论基础和实践指导 ......