戊乙奎醚光学异构体与毒蕈碱型受体亚型的分子对接研究
亲和性,结合能,1材料,2方法,1配体的准备,2M1~M4受体蛋白的准备,3同源建模构建M5受体蛋白,4分子对接,5对接的准确性判断,6结合能计算,3结果与分析,1M5受体的同源建模结果,2分子对接结果,4讨
张丽娟,白兰,师健友,何俊(1.四川省医学科学院/四川省人民医院药学部,成都610072;2.四川大学华西医院肿瘤中心生物治疗实验室,成都 610041)
戊乙奎醚光学异构体与毒蕈碱型受体亚型的分子对接研究
张丽娟1*,白兰1,师健友1,何俊2#
(1.四川省医学科学院/四川省人民医院药学部,成都610072;2.四川大学华西医院肿瘤中心生物治疗实验室,成都 610041)
目的:研究戊乙奎醚光学异构体对毒蕈碱型(M)受体亚型的亲和性,为揭示戊乙奎醚的作用靶点及药效选择性提供参考。方法:利用同源建模和分子对接等分子模拟技术,通过比较戊乙奎醚不同光学异构体R1(3R,2′R)、R2(3R,2′S)、S1(3S,2′R)和S2(3S,2′S)与M受体亚型M1~M5的结合能,判断其与M受体亚型的亲和性。结果:戊乙奎醚4个光学异构体均能够对接到M受体各亚型的活性位点,不同异构体与不同M受体亚型的分子对接显示出较大差异。4个光学异构体与M3受体具有较大的结合能,在5 736.519~5 907.143 kcal/mol之间;R1与M1的结合能为1 190.04 kcal/mol;而其他光学异构体与各受体亚型的结合能较低或为负数。结论:戊乙奎醚的异构体R1对M1受体具有亲和性,4个光学异构体均对M3受体具有亲和性。
戊乙奎醚;光学异构体;毒蕈碱型受体;亚型;分子对接;同源建模
ABSTRACTOBJECTIVE:To study the affinity of penehyclidine optical isomers to muscarinic(M)receptor subtypes,and provide reference for revealing the action targets and efficacy selectivity of penehyclidine.METHODS:Homology modeling,molecular docking and other molecular simulation technologies were used to analyze and predict the binding energy of 4 optical isomers to M receptor subtypes and judge its affinity by comparing the binding energy of different optical isomers R1(3R ......
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