郭小华 朱燕亮 程齐来

    中图分类号 R287；R914.2 文献标志码 A 文章编号 1001-0408(2018)17-2351-05

    DOI 10.6039/j.issn.1001-0408.2018.17.11

    摘 要 目的：研究银翘散中17个主要抗流感病毒成分与神经氨酸酶(NA)的结合模式和相互作用。方法：采用CORINA、UCSF Chimera 1.3、AutoDock Tools 1.5.4等分子对接软件，将银翘散中的甘草素、甘草苷、绿原酸、3，3′ ，4-三甲氧基鞣花酸等17个活性成分及阳性对照扎那米韦的二维结构转化成三维结构，确立其空间坐标，再设置受体蛋白NA的网格，并运行对接程序进行对接运算。以估计抑制常数(Ki)和结合自由能(ΔGbind)为参考指标，比较对接分子的虚拟活性差异，并从对接构象上分析产生活性差异的原因。结果：在17个活性成分中，绿原酸对接的Ki值为1.20 ?mol/L，ΔGbind值为-8.08 kcal/mol(1 kcal=4.184 kJ)，优于扎那米韦(Ki值为2.26 ?mol/L，ΔGbind值为-7.70 kcal/mol)；3，3′ ，4-三甲氧基鞣花酸对接数据最差，Ki值和ΔGbind值分别为149.41 ?mol/L、 -5.22 kcal/mol。在对接构象上，绿原酸与扎那米韦相似，在空间上更加匹配NA活性腔的活性位点，占据了除S5以外的所有活性位点，呈现出与NA较强的结合作用。3，3′ ，4-三甲氧基鞣花酸的平面分子结构限制了其与NA多个活性位点结合，对接构象不牢固。结论：绿原酸可能是银翘散中最强的抗流感病毒活性成分，其虚拟活性强于扎那米韦；3，3′ ，4-三甲氧基鞣花酸空间上與NA活性腔不匹配，虚拟活性最弱。本研究可为NA抑制剂的开发提供一定的理论指导。

    关键词 银翘散；活性成分；抗病毒；神经氨酸酶；分子对接

    ABSTRACT OBJECTIVE： To study the binding mode and interaction of 17 main antiviral components in Yinqiao powder with neuraminidase (NA). METHODS： The two-dimensional structure of 17 active components as glycyrrhizin， liquiritin， chlorogenic acid， 3，3′ ，4-trimethoxy ellagic acid in Yinqiao powder and positive control zanamivir were transformed into three-dimensional structure by using CORINA ......