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编号:13557238
采用网络药理学研究桃仁—红花药对治疗股骨头坏死的分子机制(3)
http://www.100md.com 2019年4月1日 《中国药房》 20197
     1.7 基因本体生物过程与京都基因与基因组百科全书通路富集分析

    将桃仁-红花药对的作用靶标导入DAVID中,进行基因本体(GO)分析与京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,得到通路富集结果,选取P<0.001生物过程和通路,并且按照富集基因数从大到小排序,选取排名前20的通路,使用OmicShare网站绘制通路信息图。检索相关文献,筛选可能与治疗ONFH相关的通路及潜在靶标,然后与桃仁-红花药对的活性成分构建出“活性成分-ONFH靶标- KEGG通路”的多维网络关系图。

    2 结果

    2.1 桃仁-红花药对活性成分分析

    根据OB>30%,DL>0.18,筛选出桃仁-红花药对的活性成分44个(两者均含有β-谷固醇)。其中桃仁23个,包括杨树酚苷、常春藤皂苷元、菜油甾醇等;红花22个,包括木酚素、β-类胡萝卜素、黄芩苷、槲皮素等。桃仁-红花药对部分活性成分基本信息见表1(由于本文活性成分的名称过长,故以字母和数字的组合代替)。

    2.2 桃仁-红花药对的靶标预测

    通过DRAR-CPI查找桃仁-红花药对44个活性成分的靶标,得到Z’-score<-0.5的靶标2 322个。在UniProt中输入蛋白靶标的PDB ID ......
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