甘草中黄酮类化合物的网络药理学研究Δ
蛋白激酶,1资料与方法,1数据库及软件,2甘草中黄酮类化合物的收集与筛选,3甘草中主要黄酮类化合物潜在作用靶点预测,4通路注释和分析,5甘草中黄酮类化合物-靶点-通路关系分析,2结果,1甘草中主要黄酮类化合物的筛选结果,2
张 霞 ,张 芳 ,赵建军 ,雍婧姣 ,高晓娟 ,张文华 ,王汉卿 #(1.宁夏医科大学药学院,银川75000;2.回医药现代化省部共建教育部重点实验室,银川 75000;.南京中医药大学药学院,南京 21002;.百瑞源枸杞股份有限公司,银川 750299)甘草为豆科植物甘草(Glycyrrhiza uralensisFisch.)、胀果甘草(Glycyrrhiza inflataBat.)或光果甘草(Glycyrrhiza glabraL.)的根及根茎,具有补脾益气、清热解毒、祛痰止咳、缓急止痛、调和诸药之功效[1]。现代药理学研究表明,甘草具有抗炎、抗肿瘤、抗氧化、防治病毒性肝炎、降血糖、降血压等作用;甘草的化学成分较复杂,主要为黄酮类、皂苷类、生物碱类和多糖类化合物,其中,黄酮类化合物是甘草中最重要的化学成分之一[2-4]。近年来,针对甘草黄酮类化合物药理作用的研究不断深入,但是其药效学和作用机制尚不完全明确。网络药理学(Network pharmacology)是通过分析基因、蛋白、疾病、药物等网络数据库的信息资料,利用专业分析软件及算法,整体、系统地揭示药物、靶点蛋白、疾病之间的关联,从网络层面预测药物对疾病的干预与影响。中药具有多成分、多靶点、多通路的特点,与网络药理学的系统整体观相契合[5-6]。故本研究拟采用网络药理学技术与方法,分析甘草中黄酮类化合物的靶点蛋白和作用通路,预测其可能存在的药理作用和作用机制,为进一步研究甘草的药效学、药理学及药效物质基础提供参考。
1 资料与方法
1.1 数据库及软件
中药整合药理学计算平台(TCMSP,http://lsp.nwu.edu.cn/tcmsp.php);有机小分子生物活性数据库Pub-Chem(https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/);网络拓扑属性分析软件Cytoscape 3.5.1(http://www.cytoscape.org);药效团匹配与潜在识别靶标数据库PharmMapper(http://www.lilab-ecust.cn/pharmmapper/);生物学信息注释数据库DAVID V 6.8(https://david.ncifcrf.gov/)。
1.2 甘草中黄酮类化合物的收集与筛选
依据TCMSP数据库及文献报道[7-8],结合柱色谱分离得到并经核磁共振(NMR)、质谱(MS)等分析手段确认的甘草黄酮类化合物。采用ChemBioDraw Ultra 14.0软件获取每个化合物相对分子质量和脂水分配系数信息 ......
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