郝民琦 王佳慧 李晓玲 李海龙 吴玉泓

    中图分类号 R285;R574.1 文献标志码 A 文章编号 1001-0408(2021)10-1215-09

    DOI 10.6039/j.issn.1001-0408.2021.10.10

    摘 要 目的：预测黄芪对溃疡性结肠炎(UC)的可能作用靶点与机制，为临床应用黄芪治疗UC的后续研究提供参考。方法：经中药系统药理学分析平台数据库(TCMSP)和UniProt KB数据库检索黄芪的活性成分及其对应靶点基因，经Gene Cards数据库检索UC疾病相关靶点基因，借助Venny 2.1.0在线作图工具获取黄芪与UC的交集靶点基因，并应用Cytoscape 3.7.0软件构建“药物-化合物-交集靶点”相互作用网络。利用STRING数据库获取交集靶点的蛋白质-蛋白质相互作用关系(PPI)网络，并应用Cytoscape 3.7.0软件进行可视化分析和拓扑学分析以获取核心靶点基因。借助DAVID数据库对交集靶点基因进行基因本体(GO)功能注释及KEGG通路富集，并应用Cytoscape 3.7.0软件构建“靶点-通路”富集网络。通过AutoDock vina 1.1.2软件将度值排名前5位的活性成分与核心靶点基因编码蛋白进行分子对接，应用Discovery Studio 3.5软件绘制结合模式图。结果：黄芪中共有化合物143个，共筛选出了活性成分20个，对应的靶点基因189个;UC疾病相关靶点基因共4 356个。黄芪(涉及14种活性成分)与UC的交集靶点基因有126个。PPI网络中的核心靶点基因为AKT1、MAPK1、RB1、JUN等。GO功能注释共得到GO条目2 294个(q值<0.05)，包括生物过程条目2 093个(如对脂多糖的反应、对细菌来源分子的反应等)、细胞组成条目49個(如膜筏、膜微区等)、分子功能条目152个(如核受体活性、配体激活的转录等) ......