赵俊 孙加琳 刘洪玲 刘广伟 李祥鹏 仓怀芹 梁瑜 张传洲 韩冰 隋忠国

    中圖分类号 R285 文献标志码 A 文章编号 1001-0408(2021)17-2066-08

    DOI 10.6039/j.issn.1001-0408.2021.17.04

    摘 要 目的：探讨熊果酸治疗骨质疏松症(OP)的潜在分子机制。方法：运用中药系统药理学分析平台数据库、PubMed数据库、UniProt数据库筛选单体化合物熊果酸的作用靶点基因，借助GeneCards数据库检索OP相关靶点基因，并运用Venny 2.1在线作图工具获取成分-疾病的共有靶点基因;运用STRING数据库构建成分-疾病共有靶点基因的蛋白质-蛋白质相互作用关系(PPI)网络并进行拓扑学分析，筛选度值大于平均度值的核心靶点基因;使用DAVID数据库对成分-疾病共有靶点基因进行基因本体(GO)功能注释和KEGG通路富集分析。以核心靶点基因编码蛋白为受体、熊果酸为配体，采用AutoDock Vina 1.1.2软件进行分子对接。结果：共挖掘出熊果酸相关靶点基因55个、OP相关靶点基因4 273个，两者共有靶点基因44个。上述共有靶点基因的PPI网络共包含节点44个、边513条，平均节点度值为23.3;核心靶点基因共24个，包括VEGFA、TP53、IL6、CASP3等。共富集到GO功能条目340个(校正后P值小于0.05)，其中生物过程263个(涉及凋亡过程的负调控等)、分子功能25个(涉及蛋白质结合等)、细胞组分52个(涉及胞质溶胶等);共富集到KEGG信号通路90条(校正后P值小于0.05)，如癌症通路、乙型肝炎、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B(PI3K/Akt)信号通路等。熊果酸与TP53等6个核心靶点基因编码蛋白的结合能均低于-5 kcal/mol ......