白木香查尔酮合酶(AsCHS1)基因的克隆和生物信息学分析(2)
2.4 AsCHS1基因信息学分析基因的分析工具AsCHS1基因编码蛋白的理化性质预测采用ExPASy Proteomics Server提供的在线工具Protparam (http://www.expasy.ch/tools/protparam.html);采用SWISS-MODEL(http://swissmodel.expasy.org/)进行二级结构分析和结构域的三维建模,氨基酸序列比对利用ClustalW方法进行,通过MEGA 4.0构建Neighbor-joining系统进化树。
2.5 白木香AsCHS1基因在不同伤害处理时间的表达分析
利用实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)的方法检测白木香愈伤组织中CHS基因在其不同伤害处理时间(对照CK,2,6,12,24 h)的表达情况。分析使用SYBR Green I荧光染料法,在qRT-PCR仪上进行。选取白木香Histone基因[10]作为目标基因定量表达的内参基因 ......
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