基于转录组的新疆紫草ERF转录因子家族生物信息学分析(2)
2.3.2 AeERFs蛋白二级结构特性分析 利用ExPaSy提供的在线程序SOPMA(Self-Optimized Prediction Method with Alignment,http://npsa-pbil.ibcp.fr/cgi-bin/npsa_automat.pl?page=/NPSA/npsa_sopma.html)预测分析α螺旋、β折叠、延伸链和无规则卷曲。2.3.3 AeERFs蛋白三级结构特性分析 将新疆紫草ERFs蛋白序列提交至SWISS-MODE(http://swissmodel.expasy.org/),采用同源建模法构建蛋白的空间模型。
2.3.4 保守序列预测 根据MEME(Multiple EM for Motif Elicitation)数据库(http://meme.nbcr.net/meme/cgi-bin/ meme.cgi)提供的在线检索服务,对新疆紫草ERFs蛋白做保守序列预测 ......
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