当前位置: 首页 > 期刊 > 《中国中药杂志》 > 2015年第6期
编号:12614201
支持向量机在中药肾毒性研究中的应用(2)
http://www.100md.com 2015年3月15日 中国中药杂志 2015年第6期
     1材料与方法

    1.1数据收集及整理分别以“kidneydamage”,“nephrotoxicity”,“renalfailure”,“renalinjury”和“renaltoxicity”为关键词在Drugbank数据库(http://www.drugbank.ca/)和TOXNET数据库(http://toxnet.nlm.nih.gov/)中检索,获得81个肾毒性化合物;另有43个肾毒性化合物来源于文献[13]。将以上124个化合物进行组内删重,得到肾毒性判别模型的阳性集;选择其中通过造成肾小管损坏致肾毒性的化合物,作为肾小管损坏判别模型的阳性集。在Drugbank数据库的“approved”分子表单中(内含已上市药物的结构信息),删除与肾毒性相关的化合物,再从中随机抽取适量化合物分别作为2个模型的阴性集。为提高数据的可靠性,删除肾毒性判别模型阳性集和阴性集中的共有化合物,对肾小管损坏判别模型也执行上述操作。本实验利用PowerMV(Version0.61)计算数据集化合物的6122个分子描述符来表征分子结构 ......
上一页1 2 3下一页

您现在查看是摘要页,全文长 4043 字符