模块分析法：解密复杂疾病和药物作用机制的新策略(2)
3疾病药物模块识别的重要性
从系统生物学的观点来看，生命体可看作是多种分子相互作用形成的复杂网络。大多数复杂疾病并非是由单个致病基因引起的，而是通过多个基因或其产物功能紊乱导致调控网络失衡的结果[8]。疾病表型反映了不同的病理生物学过程在一个复杂网络中的相互作用[8]。因此，在疾病网络中删除单个节点对疾病网络几乎是没有影响的，需要调节多个蛋白才能干扰疾病表型[20]。那么，如果药物的作用只影响到网络里的某一个节点，该药物将很难去逆转这种疾病表型。所以，药物是通过作用于疾病网络中的多个靶点，对各靶点的作用产生协同效应，从而对疾病的发生、发展进行干预，最终达到治疗效果[21]。这种基于网络层面的理解确实提供了一种非常形象的分析策略，有助于更好地理解疾病的发病机制，为药物发现提供了更好的药物靶标。但是与疾病或药物相关的网络，通常都是非常巨大的，会涉及到相当多的节点，很多时候直接去分析这样巨大的网络几乎是不可能的，而且也缺乏特异性。因此，为了降低网络分析的复杂性，必须要对大网络进行分解或解构，进行模块的识别。对代谢网络的研究表明，把代谢网络划分成相对独立的子网有助于更好地理解网络模块性和组织原则，而且对于代谢网络的功能分析也是必要的[22]。调控网络的研究表明motif和模块是分析网络局部特征和网络构成以及研究调控机制的重要结构[23]。
目前，模块化已经成为构建疾病网络和药物靶点网络的一个基本概念 ......
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从系统生物学的观点来看，生命体可看作是多种分子相互作用形成的复杂网络。大多数复杂疾病并非是由单个致病基因引起的，而是通过多个基因或其产物功能紊乱导致调控网络失衡的结果[8]。疾病表型反映了不同的病理生物学过程在一个复杂网络中的相互作用[8]。因此，在疾病网络中删除单个节点对疾病网络几乎是没有影响的，需要调节多个蛋白才能干扰疾病表型[20]。那么，如果药物的作用只影响到网络里的某一个节点，该药物将很难去逆转这种疾病表型。所以，药物是通过作用于疾病网络中的多个靶点，对各靶点的作用产生协同效应，从而对疾病的发生、发展进行干预，最终达到治疗效果[21]。这种基于网络层面的理解确实提供了一种非常形象的分析策略，有助于更好地理解疾病的发病机制，为药物发现提供了更好的药物靶标。但是与疾病或药物相关的网络，通常都是非常巨大的，会涉及到相当多的节点，很多时候直接去分析这样巨大的网络几乎是不可能的，而且也缺乏特异性。因此，为了降低网络分析的复杂性，必须要对大网络进行分解或解构，进行模块的识别。对代谢网络的研究表明，把代谢网络划分成相对独立的子网有助于更好地理解网络模块性和组织原则，而且对于代谢网络的功能分析也是必要的[22]。调控网络的研究表明motif和模块是分析网络局部特征和网络构成以及研究调控机制的重要结构[23]。
目前，模块化已经成为构建疾病网络和药物靶点网络的一个基本概念 ......
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