基于分子对接虚拟筛选MEK1中药抑制活性成分(3)
其中ZINC85595772为最优成分,总分、作用力评分(Polar)和QFIT评分都较好,与MEK1晶体模型形成8个氢键,特别地,针对该成分进行对接模式的分析见图3。图3中A显示ZINC85595772结合于MEK1的抑制口袋中,与口袋周围Asn78,Asn195,Asp208,Ser212,Try229形成氢键,且可以与同一个氨基酸残基形成多个氢键,对比图3中B配体GDC0973与MEK1结合位点为Lys97,Asp190,Asn195,Ser212。其中Ser212是MEK1磷酸化功能的最关键氨基酸残基[16],作为氢键供体与ZINC85595772羟基氧和GDC0973的氟原子相互作用;分析配体在MEK1的疏水作用,图3中C可观察ZINC85595772主要与Asn78,Lys97,Asp190,Asn195,Asp208,Ser212,Met219,Tyr229,Asn221,Met230形成较强疏水作用,与图3中D的GDC0973配体对比具有相似的疏水作用 ......
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