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编号:278051
忽略种族及生活方式等因素的冠状动脉粥样硬化患者常见基因分析筛查
http://www.100md.com 2017年6月15日 河北医药 2017年第11期
大洲,1材料与方法,2结果,3讨论
     陈曼丽 陈孟辉 宫蕊 张翠召 唐龙妹 齐莉莉

    ·论著·

    忽略种族及生活方式等因素的冠状动脉粥样硬化患者常见基因分析筛查

    陈曼丽 陈孟辉 宫蕊 张翠召 唐龙妹 齐莉莉

    目的 筛选冠状动脉粥样硬化主要相关基因,以指导疾病的早期诊断、远期预防。方法 检测参与冠心病(CAD)发生发展的基因,通过搜索基因表达综合数据库(GEO)收集来自不同大洲的CAD患者的血液样本基因表达研究。对各大洲CAD患者和正常对照组(NC)之间的基因表达的比较分析,确定不同大洲CAD患者和NC之间差异表达基因的普通集合(DEGS)。对差异表达基因通过Cytoscape软件,建立共同的PPI网络。了解其在CAD中的生物学作用。结果 基因库中:亚洲、欧洲和北美洲CAD患者和对照组之间,分别有575个,868个和476个基因被确定为重要的存在差异表达的基因。在三个不同大洲发现24个基因与CAD相关,6个与早起CAD或动脉粥样硬化有关的基因。在PPI网络中重要的枢纽蛋白,包括IRF4(阶=23)、PLAUR(阶=17)和hist1h2ae(阶=15)。结论 忽略民族、种族、生活方式和环境因素的差异,这种检测方式可以为了解CAD的发病机制提供重要的监测手段,并推动诊断标志物和有效的治疗策略的发展。

    冠状动脉疾病;不同大陆;基因表达;共同基因

    冠心病(CAD),作为一种复杂的慢性疾病,受遗传、环境及生活方式等多种因素影响[1,2]。尽管在CAD的预防和治疗方面取得相当大的进展,但是它的并发症、发病率和死亡率仍然很高[3],在不同的民族有很大的差异。南亚(SA)包括印度、巴基斯坦、孟加拉、或斯里兰卡血统,被认为比其他民族有更高的患冠心病的风险[4,5],可能由于一些特定的感染如结核分支杆和巨细胞病毒感染所致[6]。然而,已知的文章报告中,种族/族裔与CAD的联系是复杂的,由于在种族/族裔群体的异质性,故而报道已知性甚少。最近的大规模基因表达谱的研究,表明遗传基因表达的改变与CAD发生、发展相关,并提供了在不同大洲此类疾病发生分子环境的有价值的信息[7-10]。识别CAD的潜在的差异性表现的基因表达机制,可能会对CAD的预防和治疗确立新的目标。在这项研究中,我们假设CAD是由一组共同的基因介导的,这组基因无论种族、族裔、生活方式和(或)环境因素的差异。我们分析和比较来源于不同大洲的患有CAD人群的基因表达的明显特征,以确定一组共同表达的基因,这可能为了解CAD的发病机制提供了关键基础,并且促进诊断标志物和有效的治疗策略的发展。

    1 材料与方法 ......

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