差异基因分析揭示多耐药鲍曼不动杆菌生物被膜特性
菌体,1资料与方法,2结果,3讨论
李海涛 齐天杰 李帅 张鲁涛 王伯丽·论著·
差异基因分析揭示多耐药鲍曼不动杆菌生物被膜特性
李海涛 齐天杰 李帅 张鲁涛 王伯丽
目的 探索多药耐药鲍曼不动杆菌生物被膜状态独特的基因表达。方法 选取多药耐药鲍曼不动杆菌菌株,在同一菌株两种不同状态下,处于快速生长期的浮游菌体和生物被膜固着生长的菌体,两个样本间进行mRNA的提取和全基因基因表达的分析比对,比较两者间基因表达的差异。研究表达差异的基因在基因功能上的体现。结果 同一菌株两种不同状态下,处于快速生长期的浮游菌体和生物被膜固着生长的菌体,两个样本间进行全基因组基因表达的分析比对,两者间基因表达存在差异。同株细菌的生物被膜状态,是一种独特的存在方式,具有自己独特的生物行为和基因的表达。在两个样本对比中,发现有106个基因表达上调,92个基因表达下调。结论 表达差异基因所编码蛋白,大多参与了生物被膜形成和形态维持。细菌生物被膜形成和形态维持,是通过特殊的信号通路以及信号因子、转录因子所调节的;在浮游细菌的状态,它们不表达或者没有显著表达。
多药耐药鲍曼不动杆菌;基因分析;生物被膜;高通量测序
近期,多药耐药鲍曼不动杆菌已经被列入六大最危险机会致病病原菌之一[1]。目前多重耐药的鲍曼不动杆菌,对目前临床所应用的大多数抗生素均是耐药的,治疗困难,是目前临床亟待解决的难题。多重耐药的鲍曼不动杆菌,其耐药基因在菌落间可以快速获得和稳定遗传,增加了临床治疗难度。鲍曼不动杆菌可以快速对临床应用多种抗生素耐药,是由于β-内酰胺酶的产生,外排泵,孔蛋白,甲基化酶等多种机制,其中还有个更重要的机制,是由于菌体生物被膜的产生[2,3]。鲍曼不动杆菌常常会采用固着的生活方式,不同于浮游细菌状态;分泌多种胞外基质,将菌落包裹其中,形成生物被膜[4]。在传统意义上,人们常常认为细菌的生物被膜就是一团细菌的组合和堆叠,菌落不可逆的黏附在医疗器械或者生物体的表面;然而,近期一些学者通过蛋白质组学分析以及转录组研究发现,生物被膜不单单只是细菌菌体简单混合物。不同于浮游细菌状态,生物被膜下的菌体具有自己独特的生物行为和基因的表达[5]。存在于生物被膜内的细菌,更加耐多种抗生素,耐干燥,耐各种环境压力,甚至是紫外线的照射[2]。这就导致了,在生物被膜状态下,细菌会持续存在于各种医疗器械和导管内表面,难以清除;形成了持续稳定释放菌体的感染源[6]。鲍曼不动杆菌形成生物被膜的能力,已经成为评估其致病力的主要因素之一[7]。细菌生物被膜所引起的相关感染过程包括,细菌的慢性定植、细菌生物被膜稳固的黏附于生物和非生物(中心静脉置管、导尿管、置入支架、人工瓣膜和隐形眼镜等)的表面 ......
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