糖尿病、冠状动脉疾病及两病并存患者基因表达差异分析
测序,通路,软件,1资料与方法,2结果,3讨论
宫蕊 热依拉·牙合甫 张国亮 任珊 陈曼丽 陈孟晖 李海滨 赵成2型糖尿病(T2DM)和冠状动脉疾病(CAD)密切相关,影响公众健康,加重了经济负担。冠状动脉疾病是2型糖尿病的常见并发症,其中斑块形成致使冠状动脉变窄,严重程度影响患者冠状动脉疾病分级。T2DM和CAD常常与POMP、肥胖等疾病同时存在。T2DM与CAD具有诸多共同危险因素,如年龄,性别,体重,生活方式,心理社会压力和暴露于环境污染物等,两者均具有慢性炎症[1,2]和凝血系统紊乱特征[3]。2型糖尿病与心血管疾病发生以及死亡风险增加密切相关[4,5]。潜在机制与胰岛素抵抗、非自主调节脂质代谢、凝血异常、动脉壁生物反应效应易感基因之间复杂的相互作用等有关[6]。Wu等[7]发现2型糖尿病,肥胖和冠状动脉疾病在基因敏感区域(bin 9.3和6.5)均有表达共享。基因组信息(正常状态、疾病相关),尤其是在高通量技术对认识疾病的复杂生物过程具有重要价值[8]。本研究通过比较2型糖尿病和冠状动脉疾病基因表达谱,探讨两者之间的关联性。
1 资料与方法
1.1 一般资料 收集确诊患者及健康者(对照组)共计20例。其中T2DM患者2例,CAD患者2例,T2DM合并CAD者6例(T2DM+CAD),对照组10例。T2DM患者符合世界卫生组织诊断标准[9];PCI术后、CABG患者以及冠脉CTA血管限流>75%患者作为CAD患者入组标准[10]。T2DM与CAD并发患者满足上述2个入选标准。对照组为健康人群,年龄性别比例符合试验要求。本研究无药物干预同时不干预患者用药,通过伦理审批,向所有受试者提供书面知情同意书。
1.2 主要试剂与仪器 TRIZOL试剂;TruSeq RNA文库制备试剂盒 Ribo-Zero Magnetic kit;random primer;Superscript III;USER酶;三氯甲烷、异戊醇、无水乙醇(分析纯);DEPC water;低温高速离心机;ABI7500型快速实时荧光定量PCR仪;Nanodrop ND-2000超微量紫外分光光度计;Hiseq2500。
1.3 主要统计平台及软件TopHat v1.3.1 软件;Cufflinks v1.0.3软件;GENECODIS软件;Cytoscape软件;bwa软件;SeqPrep软件;GOrilla软件 ......
您现在查看是摘要页,全文长 8626 字符。