不同量肺泡灌洗液联合高通量测序在肺部感染性疾病中的价值
病原学,1资料与方法,2结果,3讨论
王传 顾晓静 史金英 夏静荣 陈洁呼吸系统感染性疾病严重威胁人类健康,呼吸道感染是感染性疾病中最主要的部分[1]。我国耐药形势严峻,超级细菌频繁现身。近20年来,流行性疫情频发,近2年出现的全球新型冠状病毒流行属于肺部感染性疾病。肺部感染(pulmonary infection)是指包括终末气道、肺泡腔及肺间质在内的肺实质性炎症,病因以感染最为常见。当肺部感染的病原体诊断不够明确时,尤其是重症感染患者,如不能够针对性地药物治疗,可能耽误病情,导致治疗不及时或甚至引起死亡[2,3]。快速精准诊断感染病原体是当今亟待解决的临床问题,感染性疾病病因诊断开始面临巨大挑战。传统的病原微生物学诊断手段已经不能完全满足临床需要。与传统细菌培养检测方法相比,高通量测序技术能够一次性检测获得样品中可能感染的多种病原物基因组序列,对明确病原体具有独特优势[4]。支气管肺泡灌洗可以获得气管镜所不能探及下呼吸道的细胞和溶质,能更全面地反映肺部的整体情况[5]。肺泡灌洗液的内容,细胞成份:淋巴细胞,中性粒细胞,嗜酸等,非细胞成分:细胞因子,病毒,生物标记物(蛋白、核酸)。本研究收集89例肺部感染患者,通过电子支气管镜获取肺泡灌洗液,送检高通量测序的结果及临床资料,探讨不同量的肺泡灌洗液高通量测序在肺部感染的病原学中的诊断价值。
1 资料与方法
1.1 一般资料 回顾 2016年7月至2018年10月石家庄市人民医院呼吸与危重症医学科送检北京中日医院检验科进行高通量基因测序的 89 例肺部感染患者的临床资料,年龄18~80岁,平均年龄(62.5±8.9)岁,合并基础疾病较多,以急性病程为主,影像学表现为单肺实变和双肺多叶多段病变为主。
1.2 纳入与排除标准
1.2.1 纳入标准:①18岁≤年龄≤80岁;②符合下呼吸道感染诊断标准,A发热,体温>38℃或30%,回收的灌洗液分为两管装入灭菌容器中,分别行高通量测序检测和灌洗液培养。
1.3.2 肺泡灌洗液高通量测序:采集患者的肺泡灌洗液标本,送检北京中日友好医院。(肺泡灌洗液随机分为120 ml和60 ml组,肺泡灌洗液≥10 ml,快速低温保存,室温保存4 h;>4 h,应4℃冰箱保存 ......
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