刘志红 孟令振 刘静 鲁明 王瑞英

    2型糖尿病(type 2 diabetes,T2DM)占所有糖尿病的90%[1]，是胰岛素抵抗和胰岛素缺乏的结果，其中肝脏胰岛素抵抗是T2DM发病机制的重要组成部分[2]。目前导致肝脏胰岛素抵抗的发病机制仍有争议，不同的假设将因果关系归因于内脏脂肪、脂肪因子、内质网应激和炎症等[3]。虽然肝脏胰岛素抵抗的病理生理学是复杂和多因素的，但研究特定的分子机制可能为改善糖尿病肝脏胰岛素抵抗提供新的治疗策略。近年来，大量的基因芯片数据可以从公共数据储存库中免费获得，越来越多的研究者投入巨大的精力挖掘数据集中有价值的信息用于疾病的研究[4,5]，为糖尿病的诊断、治疗提供新的生物标志物。本研究通过生物信息学手段，从GEO数据库中寻找到关于T2DM肝脏的基因芯片数据集同时结合CTD数据库的IR相关基因，分析与肝脏IR差异表达基因(DEGs)及其通路，以期寻找到改善IR的关键靶点。

    1 资料与方法

    1.1 一般资料 通过检索词“type 2 diabetes”和“hepatic”在 GEO 数据库(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)中下载数据集 GSE15653，该芯片数据由Pihlajam?ki等[6]于 2009年4月提交，以GPL96(HG-U133A)Affymetrix Human Genome U133A Array为研究平台，分析4例2型糖尿病(GSM391707-GSM391710)及5例正常(GSM391693-GSM391697)肝脏组织的基因表达矩阵。

    1.2 肝脏胰岛素抵抗差异基因筛选与可视化 利用 GEO2R在线分析工具对 GSE15653数据集样本进行分组并筛选出DEGs，以P值<0.01以及logFC绝对值≥1为筛选条件。使用ggplot2进行差异基因的可视化[7] ......