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DNA修复维系生命(2)
http://www.100md.com 2015年12月1日 《百科知识》 2015年第23期
     莫德里奇的贡献

    莫德里奇在美国新墨西哥州一个小城长大。1963年,莫德里奇17岁时,做生物老师的父亲告诉他DNA很重要,那一年恰恰是沃森-克里克因发现DNA双螺旋结构获诺贝尔生理学或医学奖的第二年。父亲对他说:“你应该去学一点DNA的知识。”

    此后,莫德里奇不仅学了生物,而且一直以DNA为研究对象。在斯坦福大学读博士和做博士后研究,以及在杜克大学担任助理教授期间,莫德里奇始终与DNA酶打交道,使用DNA连接酶、DNA聚合酶以及限制性内切酶开展研究。20世纪70年代末,莫德里奇的研究兴趣转向Dam甲基化酶,获得了重大发现。

    Dam甲基化酶负责DNA与甲基成分结合,是由大肠杆菌染色体编码的两种甲基化酶之一,是Dam基因的产物,可将GATC序列中的腺嘌呤转变成6-甲基腺嘌呤。莫德里奇的研究表明,这种甲基成分可以充当标签,帮助特定限制性内切酶在DNA分子链正确位置上切割。在此之前,美国哈佛大学分子生物学家梅塞尔森发现一种带数个DNA碱基错误配对的细菌病毒在其碱基配对中,原本应该在腺嘌呤A对面的胸腺嘧啶T被改成了胞嘧啶C。他用这些病毒去感染细菌时,这些被感染的细菌竟然修复了这些配对错误。
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    因此,梅塞尔森在1976年提出一种猜想,细菌存在某种修复机制,能在DNA复制时改正错误。莫德里奇与梅塞尔森合作,共同创造了一种带有数个DNA配对错误的病毒。莫德里奇的Dam甲基化酶用来为DNA链添加

    甲基。当用这些病毒感染细菌之后,受感染的细菌改正了那些缺乏甲基的DNA分子链。这表明,DNA配对错误的修复是一种自然过程,能够在DNA进行复制时修正其中的错误,其原理是利用未甲基化的DNA作为参考链,识别存在配对错误的DNA链。

    DNA错配修复需要区分母链和子链,做到只切除子链上错误的核苷酸,而不会切除母链上本来就正常的核苷酸,然后通过DNA聚合酶Ⅲ和DNA连接酶的作用,合成正确配对的双链DNA。DNA错配修复是一个系统在起作用。这个系统主要包括错配矫正酶、DNA聚合酶Ⅲ和DNA连接酶等多种蛋白参与,步骤分为启始、切除和修复。

    莫德里奇在1989年发表了相关工作的结果,这些结果只是对细菌研究获得。莫德里奇也对人体内的这一修复机制进行了研究。人体细胞的DNA进行复制时,这种配对错误修正机制也起到了关键性的作用,但目前仍然不清楚机体是如何识别最初版本的那条染色体链的,即原核生物是依靠甲基化程度来判断哪条是新合成链,而真核生物是如何识别错配单链的机制尚未明确。
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    桑卡的贡献

    桑卡的贡献是发现了核苷酸切除修复机制。桑卡在伊斯坦布尔大学学医学时就对生命分子非常痴迷。毕业后,桑卡在土耳其做了几年医生,1973年桑卡发现,致命剂量紫外线照射细菌使其死亡后,蓝色光可让这些细菌复活。这引起了他的极大兴趣,并决定解开这个谜,由此他选择了学生物化学。

    由于美国科学家鲁伯特曾研究过这一现象,桑卡决定到达拉斯的鲁伯特实验室学习。1976年,桑卡完成了他的博士论文,该论文解开了细菌复活的一些奥秘。桑卡克隆了紫外线DNA损伤的修复酶基因:光修复酶,并成功地用细菌进行了表达。但是,这一研究并没有引起人们太多关注。

    博士毕业后,桑卡先后三次申请博士后研究职位都未成功。后来,桑卡在美国耶鲁大学医学院找到一份实验室技术员的工作,得以继续开展对DNA修复机制的研究,正是在这里桑卡完成了其获得诺贝尔化学奖的工作。
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    美国耶鲁大学的研究人员早在20世纪60年代中期就开始对细菌在黑暗中具有某种修复DNA的机制进行了研究。他们借助三种对紫外线敏感度不同的细菌,确定了uvrA、uvrB和uvrC三种蛋白不同的基因变异。加上桑卡的研究,人们知道细菌拥有两种紫外线损伤DNA的修复机制,一种是光修复酶,需要依靠光照发生作用。另一种是在黑暗中起作用的三种蛋白(酶)。

    桑卡对这种黑暗中起作用的修复机制也充满极大兴趣。1983年,他成功确定了与这三种不同基因变异相关的修复酶,即鉴定出了黑暗修复系统的三种蛋白(uvrA、uvrB和uvrC),并阐明了DNA损伤修复机制。

    原来紫外线照射可使相邻两个胸腺嘧啶碱基TT自身以共价相连形成二聚体,黑暗修复系统的三种蛋白可特异性识别DNA损伤部位,并

    能分别在受破坏DNA片段的上方和下方链条上进行两次切割,切除整个受破坏的12~13个核苷酸DNA片段。切除造成的切口在DNA聚合酶的催化下最终完全修复。这就是核苷酸切除修复。
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    DNA修复的应用

    除了碱基切除修复机制、配对错误修复机制和核苷酸切除修复机制外,细胞还存在着其他一些DNA修复机制,用以维护DNA序列的稳定,并维护生命。这些修复系统随时修正数以千计因太阳照射、吸烟或其他有害物质摄入导致的DNA损坏,对抗每次细胞分裂时出现的DNA自发性突变倾向,在复制阶段,需要修正数以千计的错误配对。一旦离开这些修复机制,人的基因组将会崩溃。只要有错误发生,遗传信息就可能发生变化,患癌的风险也会明显上升。

    人之所以患各种癌症一定与这些DNA修复机制被关闭或失效有关。一旦这些DNA修复机制失去作用,癌细胞DNA就会变得不稳定,这也是为何癌细胞时常会发生变异并变得对化疗耐受的原因。同时,癌细胞甚至比健康细胞有更强大的修复能力。一旦离开了修复机制,癌细胞的DNA会遭受严重破坏,细胞也会死亡。
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    现在研究人员正在尝试利用这一点开发抗御癌症的药物。促进癌细胞已受损的修复机制加速崩溃或抑制癌细胞的修复机制,就能减缓甚至阻止癌细胞生长。

    根据DNA修复机理研发的药物最为著名的是聚腺苷酸二磷酸核糖转移酶(PARP)抑制剂,这既是当今癌症治疗的一个新靶点,也是利用DNA修复原理形成的一种新化疗方法(化学药物)。由于PARP参与DNA修复和转录调控,因此不仅在调节细胞存活和凋亡过程中具有关键作用,而且也是肿瘤发展和炎症发生过程中的主要转录因子。PARP在碱基切除修复的DNA单链缺口(SSBs)修复中具有关键作用,因此,抑制其活性能够增强放疗和DNA损伤类化疗药物的效果。

    大量试验表明PARP抑制剂既可作为放化疗增敏剂使用,也可单独使用,可选择性杀伤DNA修复缺陷的肿瘤细胞,如BRCA1和BRCA2缺陷的乳腺癌细胞。PARP抑制剂通过抑制癌细胞DNA损伤修复、促进癌细胞发生凋亡,从而增强放疗以及烷化剂和铂类药物化疗的疗效。
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    除了可提高化疗药的疗效外,PARP抑制剂作为单药对BRCA突变的患者也有效。BRCA突变的患者基因重组功能已经缺失,再通过PARP抑制剂抑制癌细胞DNA的修复,则可以加速癌细胞死亡。另外,PARP抑制剂不仅对BRCA1或BRCA2突变产生作用,也可能与许多还未发现的基因突变存在协同杀伤癌细胞的作用。

    在DNA修复机理的启示下,如今已有10多种PARP抑制剂在临床使用或进行临床试验。未来,这方面的新药还会层出不穷地产生。当然,从医药史的角度看,PARP抑制剂一类新药可以称为新型DNA药物,是人类的第三次药物革命。第一次药物革命是20世纪30年代至60年代,以阿司匹林、青霉素为代表;第二次药物革命是20世纪70年代到20世纪末,许多至今畅销的药物,如抗癌的化疗药物都是在这一时期发明的。第三次药物革命产生的DNA药物则已跨入精准医疗的门槛。

    【责任编辑】张田勘, 百拇医药(杨欣)
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