S100B基因rs881827多态性与缺血性脑卒中的遗传易感性研究(1)
【摘要】目的探讨星形胶质源性蛋白(S100B)基因单核苷酸多态性(SNP)rs881827与缺血性脑卒中(IS)的相关性。
方法采用单碱基延伸的PCR技术(SBEPCR)和DNA测序法对396例IS患者(病例组)及398例体检者(对照组)的S100B基因rs881827位点进行基因分型；用非条件Logistic回归计算比值比(OR)、95%置信区间(95%CI)、显性模型(TT/CT vs.CC)、隐性模型(CT/CC vs.TT)和超显性模型(CC/TT vs.CT)，从而分析rs881827多态性与IS的发病风险。
结果两组间基因型和不同遗传模型比较结果显示，rs881827位点SNP可能与IS的遗传易感性无关(CT vs.TT：OR=0.79，95%CI 0.54～1.15，P=0.22； TT vs.CC：OR=0.65，95%CI 0.38～1.09，P=0.10；TT/CT vs.CC： OR=0.75，95%CI 053～1.07，P=0.12；CT/CC vs.TT：OR=0.74，95%CI 0.46～1.19，P=0.22；CC/TT vs.CT：OR=0.90，95%CI 0.64～1.26，P=0.53)。
结论S100B基因rs881827位点SNP可能与IS的遗传易感性无关。
【关键词】S100B；缺血性脑卒中；单核苷酸多态性；易感性
中图分类号：R743.3；R394 文献标识码：ADOI：10.3969/j.issn.10031383.2017.05.001
Study on polymorphisms of rs881827 in S100B gene and geneticsusceptibility to ischemic stroke
[HJ2][HJ]
LU Yulan1，HUANG Huatuo1，WANG Rong1，LIU Chunhong3，LAN Yan2，WEI Yesheng3▲
(1.Graduate School，2.Department of Dermatology of Affiliated Hospital，3.Department of Laboratory Medicine of Affiliated Hospital，Youjiang Medical University for Nationalities，Baise 533000，China)
[HJ2][HJ]
【Abstract】ObjectiveTo investigate the relationship between single nucleotide polymorphism(SNP)rs881827 in S100B gene and susceptibility to ischemic stroke(IS).
MethodsSNP rs881827 genotyping in S100B gene was performed by polymerase chain reactionsingle base extension PCR(SBEPCR)and DNA sequencing among 396 cases of IS patients(case group)and 398 physical examinees(control group).Odds ratio(OR)，95% confidence intervals(95%CI)，dominant model(TT/CT vs.CC)，recessive model(CT/CC vs.TT)and over dominant model(CC/TT vs.CT)were measured by unconditional Logistic regression analysis to analyze the risk of rs881827 polymorphism and IS.
ResultsComparison of genotypes and different genetic models between the two groups showed that SNP in rs881827 locus may be unrelated to the genetic susceptibility of IS(CT vs.TT：OR=0.79，95%CI 0.54～1.15，P=0.22；TT vs.CC：OR=0.65，95%CI 0.38～1.09，P=0.10；TT/CT vs.CC：OR=0.75，95%CI 0.53～1.07，P=0.12；CT/CC vs.TT：OR=0.74，95%CI 0.46～1.19，P=0.22；CC/TT vs. CT：OR=090，95%CI 0. 64～1.26，P=0.53).
ConclusionS100B gene rs881827 polymorphism may be not associated with susceptibility to IS.
【Key words】S100B；IS；SNP；susceptibility
缺血性脑卒中(Ischemic stroke，IS)是由多因素共同参与而导致的一类复杂疾病，具有高发病率、高致残率、高复发率和高死亡率的特点，给社会和家庭带来沉重的经济负担[1]。近年来，我国IS的发病率逐年上升，而且发病人群呈年轻化趋势[2]。流行病学研究表明年龄、性别、肥胖、高血压、糖尿病、吸烟和血脂异常等传统因素与IS的发病密切相关[3]。然而，IS的确切病因及發病机制至今尚未完全阐明。越来越多的家族性病例报道说明IS有明显的遗传倾向[4]。星形胶质源性蛋白(S100B)是一种主要由星形胶质细胞分泌的酸性钙结合蛋白，为S100超家族中的成员之一。S100B可通过与晚期糖基化终末产物受体(RAGE)结合后激活蛋白激酶/cJun氨基末端激酶(JNK)通路及P38丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)通路，从而导致细胞应激和细胞凋亡[5～6]。此外，S100B与RAGE结合可诱导IL1、IL6、IFNγ、TNFα等细胞因子表达上调，从而参与机体免疫调控和炎症反应[7]。既往研究表明，S100B蛋白可作为辅助诊断缺血性脑卒中、颅脑损伤和肿瘤脑转移的有效指标[8～10]。随着分子生物学技术的不断发展，人们发现编码S100B基因存在单核苷酸多态性(SNP)位点，而这些SNP位点与自闭症、精神分裂症等多种疾病密切相关[11～12]。然而，S100B基因多态性与IS发病是否相关尚未见报道。因此，在本研究中，我们通过病例对照研究的方法，探讨S100B基因多态性与IS的发病风险，为从分子水平上揭示IS的发病机制提供依据，也为尽快发现IS的危险人群、预防IS的发生提供重要的参考信息。, http://www.100md.com(陆玉兰黄华佗王荣刘纯宏蓝艳韦叶生)
方法采用单碱基延伸的PCR技术(SBEPCR)和DNA测序法对396例IS患者(病例组)及398例体检者(对照组)的S100B基因rs881827位点进行基因分型；用非条件Logistic回归计算比值比(OR)、95%置信区间(95%CI)、显性模型(TT/CT vs.CC)、隐性模型(CT/CC vs.TT)和超显性模型(CC/TT vs.CT)，从而分析rs881827多态性与IS的发病风险。
结果两组间基因型和不同遗传模型比较结果显示，rs881827位点SNP可能与IS的遗传易感性无关(CT vs.TT：OR=0.79，95%CI 0.54～1.15，P=0.22； TT vs.CC：OR=0.65，95%CI 0.38～1.09，P=0.10；TT/CT vs.CC： OR=0.75，95%CI 053～1.07，P=0.12；CT/CC vs.TT：OR=0.74，95%CI 0.46～1.19，P=0.22；CC/TT vs.CT：OR=0.90，95%CI 0.64～1.26，P=0.53)。
结论S100B基因rs881827位点SNP可能与IS的遗传易感性无关。
【关键词】S100B；缺血性脑卒中；单核苷酸多态性；易感性
中图分类号：R743.3；R394 文献标识码：ADOI：10.3969/j.issn.10031383.2017.05.001
Study on polymorphisms of rs881827 in S100B gene and geneticsusceptibility to ischemic stroke
[HJ2][HJ]
LU Yulan1，HUANG Huatuo1，WANG Rong1，LIU Chunhong3，LAN Yan2，WEI Yesheng3▲
(1.Graduate School，2.Department of Dermatology of Affiliated Hospital，3.Department of Laboratory Medicine of Affiliated Hospital，Youjiang Medical University for Nationalities，Baise 533000，China)
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【Abstract】ObjectiveTo investigate the relationship between single nucleotide polymorphism(SNP)rs881827 in S100B gene and susceptibility to ischemic stroke(IS).
MethodsSNP rs881827 genotyping in S100B gene was performed by polymerase chain reactionsingle base extension PCR(SBEPCR)and DNA sequencing among 396 cases of IS patients(case group)and 398 physical examinees(control group).Odds ratio(OR)，95% confidence intervals(95%CI)，dominant model(TT/CT vs.CC)，recessive model(CT/CC vs.TT)and over dominant model(CC/TT vs.CT)were measured by unconditional Logistic regression analysis to analyze the risk of rs881827 polymorphism and IS.
ResultsComparison of genotypes and different genetic models between the two groups showed that SNP in rs881827 locus may be unrelated to the genetic susceptibility of IS(CT vs.TT：OR=0.79，95%CI 0.54～1.15，P=0.22；TT vs.CC：OR=0.65，95%CI 0.38～1.09，P=0.10；TT/CT vs.CC：OR=0.75，95%CI 0.53～1.07，P=0.12；CT/CC vs.TT：OR=0.74，95%CI 0.46～1.19，P=0.22；CC/TT vs. CT：OR=090，95%CI 0. 64～1.26，P=0.53).
ConclusionS100B gene rs881827 polymorphism may be not associated with susceptibility to IS.
【Key words】S100B；IS；SNP；susceptibility
缺血性脑卒中(Ischemic stroke，IS)是由多因素共同参与而导致的一类复杂疾病，具有高发病率、高致残率、高复发率和高死亡率的特点，给社会和家庭带来沉重的经济负担[1]。近年来，我国IS的发病率逐年上升，而且发病人群呈年轻化趋势[2]。流行病学研究表明年龄、性别、肥胖、高血压、糖尿病、吸烟和血脂异常等传统因素与IS的发病密切相关[3]。然而，IS的确切病因及發病机制至今尚未完全阐明。越来越多的家族性病例报道说明IS有明显的遗传倾向[4]。星形胶质源性蛋白(S100B)是一种主要由星形胶质细胞分泌的酸性钙结合蛋白，为S100超家族中的成员之一。S100B可通过与晚期糖基化终末产物受体(RAGE)结合后激活蛋白激酶/cJun氨基末端激酶(JNK)通路及P38丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)通路，从而导致细胞应激和细胞凋亡[5～6]。此外，S100B与RAGE结合可诱导IL1、IL6、IFNγ、TNFα等细胞因子表达上调，从而参与机体免疫调控和炎症反应[7]。既往研究表明，S100B蛋白可作为辅助诊断缺血性脑卒中、颅脑损伤和肿瘤脑转移的有效指标[8～10]。随着分子生物学技术的不断发展，人们发现编码S100B基因存在单核苷酸多态性(SNP)位点，而这些SNP位点与自闭症、精神分裂症等多种疾病密切相关[11～12]。然而，S100B基因多态性与IS发病是否相关尚未见报道。因此，在本研究中，我们通过病例对照研究的方法，探讨S100B基因多态性与IS的发病风险，为从分子水平上揭示IS的发病机制提供依据，也为尽快发现IS的危险人群、预防IS的发生提供重要的参考信息。, http://www.100md.com(陆玉兰黄华佗王荣刘纯宏蓝艳韦叶生)