狼疮性肾炎相关基因的共表达网络构建与分析(2)
1对象与方法1.1研究对象
对公共的基因芯片数据库GEO(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)进行LN相关样本检索,得到GEO数据库中GSE32591、GSE81622、GSE99967共3个LN人群研究的数据集。GSE32591为来自LN患者肾小球组织和正常对照组、肾间质组织和正常对照组进行对比的表达谱芯片,GSE81622为将LN患者与正常对照组的外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cell,PBMC)进行比较的表达谱芯片,GSE99967为LN患者与正常对照组的外周血进行比较的表达谱芯片。
1.2研究方法
1.2.1差异基因选取
GEO2R程序是NCBI中基于R语言的在线分析程序,我们使用GEO2R平台(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/geo2r/)将样本分组并筛选差异基因,按平台默认方案选出每个芯片中表达差异明显的基因 ......
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