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编号:110611
m6A甲基化基因对皮肤黑色素瘤发病影响的分析
http://www.100md.com 2020年3月8日 右江医学 2020年第12期
     王淮 杨健康

    【摘要】?目的?通过对皮肤黑色素瘤以及正常皮肤的m6A相关基因的表达和预后进行分析,探索皮肤黑色素瘤的发病机制。方法?从UCSC Xena上下载TCGA黑色素瘤病人和GTEx正常人皮肤组织的RNA表达数据,对文献报道的23个m6A相关基因进行差异表达分析;对表达有差异的基因使用R语言survival包进行生存分析,并得到与预后关系最密切的基因;采用GESA分析方法预测预后相关基因富集的基因集。结果?表达分析找到的差异基因共有21个,其中与预后关系最密切的基因只有3个,分别是IGF2BP1、METTL3和YTHDC2。在GSEA分析中,IGF2BP1、METTL3和YTHDC2主要富集在心脏肌肉收缩、核苷酸切除修复、RNA降解、泛素介导的蛋白质水解、基础转录因子、MTOR信号通路、非小细胞肺癌和胰腺癌等基因集。结论?m6A相关的基因中,IGF2BP1、METTL3和YTHDC2可能通过多种途径影响皮肤黑色素瘤的发生,未来可能可以作为该疾病的预后标志或潜在治疗靶点。

    【关键词】?m6A基因;黑色素瘤;表达差异;生存分析;生物信息学分析

    中图分类号:R394.3?文献标志码:A?DOI:10.3969/j.issn.1003-1383.2020.12.002

    【Abstract】?Objective?To explore the pathogenesis of skin cutaneous melanoma by analyzing the expression and prognosis of m6A-related genes in cutaneous melanoma and normal skin.Methods?RNA expression data of TCGA melanoma tissues and GTEx normal skin tissues were downloaded from UCSC Xena, and 23 m6A-related genes reported in literatures were analyzed for differential expression; survival analysis was carried out on genes with differential expression by using R language survival package ......

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