关于嵛山岛的历史，已知有近千年之久。据考证，岛上早在北宋初期即有人居住，有一位名叫邱一引的人，于宋至道三年(997年)迁居嵛山。据硖门瑞云《邱氏族谱》载：“五世祖一引公始居嵛山，妣林氏，生子大行，仁宗朝景祐丙子科(1036年)举人，妣谢氏，生兆文公。墓葬嵛山东角上弯，坐卯向酉。”据说邱姓先人于南宋王朝覆灭之前夕，为扶持大宋政权曾在嵛山进行过抗元斗争，那时正值文天祥、陆秀夫、张世杰等扶帝昺转战浙闽粤沿海。邱氏后代因避沿海战乱，多次迁回内地。

    只要不是战争年代，嵛山自古以来就能安居乐业，就如明万历《福宁州志》所言：“地肥产繁，中有三十六澳，居民稠密。”自宋以后，直到明朝初年，嵛山岛就不断地有居民迁入，来此垦土为田，繁衍生息。

    打破嵛山岛安宁祥和状态的是倭寇的侵扰。

    明朝初年，东南沿海屡犯倭患，朝廷不得不采取防范措施。洪武二十一年(1388年)，明太祖朱元璋命信国公汤和行视闽粤，筑城增兵，置福建沿海福宁、镇东、平海、永宁、镇海五卫 ......