基于生物信息学方法筛选分析与COPD相关基因
共表达,肺泡,气道,1资料与方法,2结果,3讨论
吴德洪(成都市第三人民医院呼吸与危重症医学科,四川 成都 610031)
慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)简称慢阻肺,是最常见的慢性气道疾病,由于吸烟和日益严重的空气污染,预计其未来发病率将进一步升高[1]。COPD发病机制复杂,最重要的机制之一为炎症[2],表现为气道或肺泡异常,且多种炎症细胞参与,肺泡巨噬细胞被认为是其中最重要的炎症细胞之一[3]。肺泡巨噬细胞是肺泡腔表面的主要细胞类型,是炎症发生和消退的主要调节因子[4]。因此,深入探究肺泡巨噬细胞参与COPD所涉及的分子生物学机制,将为进一步研究COPD发生发展机制提供理论依据以及潜在治疗靶点。本研究通过挖掘慢阻肺肺泡巨噬细胞基因芯片数据以探究慢阻肺发病过程中可能的关键基因,现报道如下。
1 资料与方法
1.1 数据来源 登录GEO数据库(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)搜索并筛选出GSE130928芯片数据,含24名健康非吸烟者与22名慢阻肺患者,标本为经支气管肺泡灌洗液提取的肺泡巨噬细胞。
1.2 DEGs分析 使用R软件工具包筛选DEGs ......
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