Excel软件结合Visual Basic编程工具探索MicroRNA-501对肺鳞癌患者生存情况的影响
置信区间,对数,1资料与方法,1获取数据,2Kaplan-Meier法生存分析的介绍,3对数秩检验法的介绍,4Excel与VBA在生存分析中的使用,2结果
黄致远,江文豪,杨福贵,朱 磊,董 林,汪令伟,冯明昊,魏 亮,王光学*,李钦传,*1.同济大学附属东方医院心胸外科(上海 200120)
2.同济大学附属东方医院转化医学研究中心(上海 200120)
非小细胞肺癌(Non-small cell lung cancer, NSCLC)是肺癌的主要类型,约占所有病例的80%[1]。NSCLC包括几个组织学亚型,如腺癌、鳞状细胞癌和大细胞癌。microRNA(miRNAs)是19-25个核苷酸长的单链非编码RNA,通常通过与3’非翻译区域(3’-UTR)结合在转录后水平负调控基因表达[2-3]。人们发现在肝细胞癌和前列腺癌中miR-501-3p可能起抑癌作用[4-5]。此外,miRNA微阵列研究表明,miR-501-3p与肺癌骨转移相关[6]。生存分析是探究microRNA表达情况对肿瘤患者生存时间影响大小的常用方法。目前科研工作者在需要使用生存分析相关操作的时候多使用SPSS等专业的统计软件[7-8],其缺点在于专业性高、操作性差。Excel软件由美国的Microsoft公司开发,在全世界普遍使用,可以实现一般的t检验,F检验,线性回归和方差分析等常见统计方法[9-12]。本文旨在利用Excel软件中自带的Visual Basic(VBA)编程功能,分析肺鳞癌患者组织中的miR-501表达水平与患者生存时间之间的关系。
1 资料与方法
1.1 获取数据
登录https://kmplot.com/analysis/网站,点击start miRPower for pan-cancer按钮,在新页面的Gene symbol框中输入hsa-miR-501。在Split patients by选项中选择median,使用肿瘤组织中has-miR-501表达量的中位数区分高表达和低表达,在plot options中选择Export plot data as text并在癌症类型中勾选Lung squamous cell carcinoma。其余选项保持默认即可。点击Draw Kaplan-meier plot按钮。在新页面中点击Export plot data as text即可获得原始数据,见图1。

图1 数据格式Figure 1.Data Format ......
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