陈 楠，陶志敏

    1. 江苏大学医学院(江苏镇江 212013)

    2. 江苏省检验医学重点实验室(江苏镇江 212013)

    冠状病毒在系统分类上属于套式病毒目(nidovirales)冠状病毒科(coronaviridae)冠状病毒属(coronavirus)[1]。不同类型的冠状病毒在导致疾病的严重程度和传播范围上存在明显差异。现已发现可以感染人类的冠状病毒7种，其中以HCoV-229E、HCoV-OC43、HCoV-NL63和HCoVHKU1常见，可导致免疫功能正常的宿主产生普通感冒的症状[2-3]，其余3种包括SARS-CoV[4]、MERS-CoV[5]及2019年新出现的SARS-CoV-2，可引起致命的呼吸道疾病[6]。SARS-CoV-2属于β冠状病毒，有包膜，颗粒呈圆形或椭圆形，常为多形性，直径60 ～140 nm，基因组为不分节段的单股正链RNA即ss(+)RNA[7]。COVID-19是一种传染性较强的急性呼吸系统疾病，在世界范围内快速传播，对全球公共卫生安全造成巨大威胁[8]，本文旨在从SARS-CoV-2的基因组结构和生命周期，以及其所引起的COVID-19的流行病学、发病机制、诊断、治疗和预防等方面进行综述。

    1 基因组结构

    Lu等对COVID-19患者(常见呼吸系统病原体阴性)的肺泡灌洗液进行二代测序获得SARSCoV-2基因组序列，比对分析发现SARS-CoV-2基因组与2018年在中国舟山采集的两种蝙蝠SARS样冠状病毒(bat-SL-CoVZC45和bat-SLCoVZXC21)基因组同源性高达88%，与SARSCoV和MERS-CoV基因组的同源性分别为79%和50%[9]。作为一种新型的β冠状病毒，SARSCoV-2与其他β冠状病毒基因组构成一致，基因组全长约30 kb，包含5’和3’非翻译区(UTR)、6个功能性开放阅读框(ORFs)以及8 个散在分布于结构基因之间的非结构ORFs(图1)，各基因功能见表1[10]。6 个功能性开放阅读框基因顺序为(5’→3’)复制酶(ORF1a/ORF1b)、刺突蛋白(spike，S)、包膜糖蛋白(envelope，E)、膜糖蛋白(membrane，M)、核衣壳蛋白(nucleocapsid，N)。SARS-CoV-2与SARS-CoV结构蛋白E、M和N的氨基酸同源性高达90%以上，而S蛋白的同源性较低。另外，SARS-CoV-2大部分非结构蛋白与SARS-CoV的氨基酸同源性达85%以上[11]。 ......