临床实践指南实施性促进研究之六:临床实践指南知识图谱构建中关于基本信息、背景和方法的建模表征研究
续表,浸润性,膀胱癌,1设计建设阶段,1对指南基本信息,背景和方法内容进行结构化组织,2模式层(本体层)设计,3数据层(实体和关系)构建,4知识存储和查询,2实例
王永博,刘郝弦,高 旷,陈沐坤,任相颖,饶映月,王诗淳,李绪辉,黄 桥,阎思宇,朱 彦,靳英辉1.武汉大学中南医院循证与转化医学中心(武汉 430071)
2.武汉大学计算机学院(武汉 430071)
3.湖北中医药大学针灸骨伤学院 (武汉 430061)
4.中国中医科学院中医药信息研究所(北京 100700)
临床实践指南是针对患者的特定临床问题,基于系统评价的证据,在比较不同干预措施利弊的基础上,形成的旨在为患者提供最佳医疗服务的推荐意见[1],一般由医学组织或是政府机关发布。目前国内外针对指南数字智能化有两个关键问题:一是如何将基于自然语言的非结构化文本指南转换成基于计算机语言的结构化电子指南;二是如何进行知识抽取、表示、融合、推理和问答,使得计算机能有效理解并高效执行结构化的指南[2-4]。知识图谱是采用语义技术形式表达的系统化、结构化、集成化的特定领域知识[5]。因此,基于知识图谱技术,将指南的非结构化数据转化成图数据库以进行存储及搜索是值得研究的[6]。当前指南知识图谱的研究主要关注从临床问题到推荐意见的内容,鲜有涉及指南基本信息及方法学内容,如指南的目标人群、指南使用者、证据收集过程、推荐意见形成过程、证据质量等级与推荐意见分级标准、利益冲突等。呈现指南的基本信息及方法学内容对促进指南的客观、公正、透明具有重要作用。此外,通过知识图谱将指南的基本信息及方法学内容与指南的临床问题和推荐意见进行整合,更有利于增强知识图谱的完整性。通过对指南的结构、知识及知识间的关系进行规范化的表示,发掘指南通用性的结构框架,并通过建模表征,将纯文本的指南转换为机器可理解的结构化指南,可极大提高指南相关术语的规范性和一致性,避免不同信息源指南的语义异构,为进一步指南数据挖掘和知识服务奠定基础。前期作者团队以《中国非肌层浸润性膀胱癌治疗与监测循证临床实践指南(2018年标准版)》[7]为例,通过系列文章介绍了基于该指南临床问题到推荐意见的知识图谱构建过程[8-10]。本文则基于该指南提出了指南基本信息、背景和方法在知识图谱中的建模表征方法,旨在丰富完善指南知识图谱构建,为指南数字智能化奠定基础,为进一步促进指南的实施与推广提供参考。
1 设计建设阶段
1.1 对指南基本信息、背景和方法内容进行结构化组织
《中国非肌层浸润性膀胱癌治疗与监测循证临床实践指南(2018年标准版)》(以下简称为“非肌层浸润性膀胱癌指南”)包含发表文献所有要素 ......
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