MTHFD2与头颈部鳞状细胞癌的肿瘤微环境相关性
标志物,通路,生物,1材料与方法,1数据来源,2基因集合富集分析,3肿瘤突变负荷分析,4免疫浸润分析,5统计学分析,2结果,1生存分析,2MTHFD2表达与临床病理的关系,3MTHFD2的GSEA研究,4MTH
史振祥,吴 洒,蔡伟松,明小平,陈 雄1. 武汉大学中南医院耳鼻咽喉头颈外科(武汉 430071)
2. 华中科技大学同济医学院附属湖北妇幼保健院妇科Ⅱ(武汉 430070)
头颈部癌症在全球癌症相关死亡率中排名第六,每年约有60 万新发病例和近50%死亡率[1-2]。头颈部鳞状细胞癌(head and neck squamous cell carcinoma,HNSCC)作为最主要的组织学类型,占所有头颈部癌症的90%以上[3]。HNSCC 来源于口腔、咽和喉的黏膜上皮细胞。吸烟、酗酒是导致口腔癌和喉癌发展的两个主要危险因素,而感染人乳头状瘤病毒(human papilloma virus,HPV)则与咽癌高度相关[2]。目前,HNSCC 的诊断是通过对原发肿瘤和(或)颈部肿块的活检来确定的,手术、放疗、化疗和免疫治疗仍是HNSCC 的主要治疗方式。HNSCC 的TNM分期系统是临床上判断预后最常用的指标,这对治疗策略的选择至关重要[4]。虽然有文献报道是否感染HPV 也能帮助评估一部分患者治疗反应与预后[2],但仍有相当一部分处于相同TNM 分期的HNSCC 患者在应用免疫治疗时可能会产生不同的临床结果[5]。相同TNM 分期的HNSCC 患者,只有少部分对免疫检查点抑制剂显示出治疗效果[6]。因此,发现新的和敏感的HNSCC 生物标志物仍然是至关重要的。
亚甲基四氢叶酸脱氢酶2(methylenetetrahydrofolate dehydrogenase 2,MTHFD2)是叶酸介导的一碳代谢的关键酶之一,在细胞核苷酸补充氨基酸(甘氨酸和丝氨酸)稳态和s-腺苷蛋氨酸(SAM)产生中发挥重要作用[7]。为满足对核苷酸供应的需求,MTHFD2表达上调,这是胚胎发生过程中细胞增殖的关键,但其在大多数成人组织中很少表达[8]。值得注意的是,由于细胞增殖的高生物合成需求,MTHFD2在多种肿瘤中显著上调。除了在肿瘤中的代谢功能外,MTHFD2在非代谢功能方面也起着至关重要的作用,如调节免疫攻击能力的免疫细胞信号通路[9]。虽然HNSCC 是一种较为常见的癌症类型,但MTHFD2在HNSCC 中的作用尚不清楚。本研究采用生物信息学方法,系统全面地获取MTHFD2在HNSCC 中的表达情况,分析与肿瘤分级分期及预后的关系,并从基因功能与信号通路、肿瘤突变负荷、肿瘤免疫浸润等角度诠释MTHFD2与HNSCC 之间的关系,以期为临床上HNSCC 的诊断和治疗提供依据。
1 材料与方法
1.1 数据来源 ......
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